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| 1 | 基于SNP标记的黄瓜杂交种纯度鉴定方法显示文摘根据国际葫芦科基因组数据库CuGenDB中序列信息,应用高分辨率熔解曲线技术筛选出用于黄瓜杂交种纯度鉴定的SNP位点CLA6(A/G),该位点在33个市售黄瓜品种中的多态信息量为0.401,处于中度多态;结合焦磷酸测序技术,建立基于CLA6位点的SNP-Pyrosequencing黄瓜杂交种纯度鉴定方法。利用该鉴定方法检测黄瓜杂交种优一90粒种子,结果其种子纯度为96.7%,该结果与CLA0位点及SSR鉴定结果相符,表明该鉴定技术适于黄瓜杂交种纯度鉴定,具有用于DUS测试分析的潜力。 | 兰青阔 张桂华 王永 赵新 朱珠 崔兴华 郭永泽 程奕 | 2012 | 中国蔬菜2012，，03X： | 24 |
| 2 | 白菜品种的SSR指纹图谱数据库的构建显示文摘本研究利用SSR标记技术筛选出合适的核心引物,对70个白菜品种进行DNA指纹分析,构建白菜SSR指纹图谱数据库。首先从500对引物中筛选出80对具有多态性的引物,再从其中选取20对多态性高,稳定性好且均匀分布在白菜10条染色体上的核心引物进行PCR扩增,引物多态信息含量(polymorphisminformationcontent,PIC)平均为0.716,变化范围0.473~0.932,平均杂合率0.5044。经PCR电泳检测统计得到的指纹图谱进行综合分析,形成各个白菜品种的SSR指纹代码,并且采用ClusterProject对构建的指纹图谱数据进行分析整理,得到各品种的指纹模式图谱,进而分析得到20个核心引物组合可以将70个白菜品种完全分开,并最终建立了白菜品种的SSR指纹图谱数据库。本研究构建的白菜品种SSR指纹图谱数据库,为建立白菜品种特异性、一致性及纯度的鉴定技术体系提供了基础依据。 | 张婉 崔继哲 于拴仓 李丽 | 2013 | 分子植物育种2013，11，6： | 22 |
| 3 | 萝卜EST资源的SSR信息分析及EST-SSRs标记开发显示文摘从NCBI数据库下载了287349条萝卜EST序列,经预处理后得到无冗余EST序列58105条,全长38 22.476kb。利用MISA搜索SSR位点,得到含有SSR位点的EST序列3523条,共3718个SSR,平均每 10.39kb就出现1个SSR。分析发现萝卜EST序列中存在265种重复基元类型,其中二、三、六核苷酸重复是主导的重复基元类型,二核苷酸中以比例高达91.34%的AG/CT重复基元为主;三核苷酸中主导的重复基元类型是AAG/CTT,比例为35.86%;六核苷酸中,存在两种主要的重复基元,分别为AAGGAG/CCTCTT和AAGAGG/CCTTCT,所占比例为12.78%。这些结果表明,萝卜 EST-SSRs出现频率较高,类型丰富,具有良好的多态性潜能和开发利用价值。使用primer3.0 批量设计,并以不同主导重复基元类型初步合成183对EST-SSR引物,以12份典型萝卜种质、1对亲本及其F1的基因组DNA为模板,对其有效性进行验证,筛选出有清晰扩增产物的引物159 对,其中具多态性引物64对;在试验亲本及其F1中表现多态性的引物30对,共显性引物27对。 | 崔娜 邱杨 李锡香 沈镝 王海平 宋江萍 | 2012 | 园艺学报2012，39，7： | 19 |
| 4 | 利用InDel标记鉴定大白菜杂交种豫新四号种子纯度显示文摘InDel(insertion deletion length polymorphism)是基于基因组测序的第三代分子标记,已在一些作物的遗传研究中得到运用。本研究以大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)杂交种豫新四号及其亲本和8个同父异母、同母异父的杂交组合为实验材料,利用InDel标记和引物组合方法对大白菜杂交种纯度进行了快速鉴定。结果表明,从104对InDel引物中筛选到3对(BrID10667、BrID90107和BrID90147)在豫新四号及其亲本间表现多态性且带型清晰稳定,这3对InDel引物对两批杂交种进行检测,第一批材料所测纯度全部为98.00%。第二批材料所测纯度分别为:100.00%、98.30%和99.10%,与田间鉴定结果 100.00%的纯度高度一致,吻合度达99.13%。利用筛选出来的3对特异性InDel引物分别对豫新四号及其4个同母异父和4个同父异母的杂交组合进行InDel分析,没有一对引物能够将豫新四号以及其4个同母异父和4个同父异母杂交组合同时区分开来。然而在这3对引物中引物BrID90107和BrID10667退火温度相同均为55℃,但是各自扩增产物位置不同,应用引物组合BrID90107和BrID10667就可以将豫新四号与其亲本及4个同父异母和4个同母异父的杂交组合完全区分开。实验结果显示,InDel标记可以快速、准确、经济地鉴定大白菜杂交种纯度,同时证明,利用引物组合的方法可以更有效地鉴别大白菜杂交种子中的生物学混杂,表明InDel标记技术在大白菜杂交种纯度室内快速检测中具有广泛的应用前景。 | 薛银鸽 原玉香 张晓伟 董森森 姚秋菊 蒋武生 田保明 张强 赵艳艳 魏小春 | 2014 | 农业生物技术学报2014，22，4： | 17 |
| 5 | 利用SSR标记鉴定结球甘蓝杂交种真实性及纯度显示文摘本研究利用公开发表的50对甘蓝SSR引物对5份结球甘蓝杂交种构建指纹图谱,对新调入的4个批次结球甘蓝杂交种与对照品种是否属于同一品种(即真实性)进行鉴定,并依据指纹图谱筛选双条带引物,对其中某一批次的10份杂交种进行纯度鉴定。指纹图谱鉴定结果表明:新调入4个批次杂交种中有3个批次与对照属于同一品种,1个批次与对照属于不同品种,与田间形态鉴定结果完全吻合。利用筛选出的SSR标记对10份甘蓝杂交种进行纯度鉴定,其中8份鉴定结果与田间形态鉴定结果一致,两种鉴定方法显著相关。本研究为利用SSR标记进行甘蓝杂交种真实性及纯度鉴定的实践可行性提供理论依据和参考。 | 石星星 纪小红 张磊 吕茜茜 刘亚婷 王玉刚 冯辉 | 2015 | 分子植物育种2015，13，2： | 17 |
| 6 | SSR标记对甜瓜品种纯度和真实性的鉴定显示文摘建立SSR指纹鉴定甜瓜杂交种纯度的技术体系,对于利用分子标记进行品种纯度和真实性鉴定具有重要的意义。以12个甜瓜杂交种及其亲本为试验材料,确定了杂合率高,能够区分甜瓜杂交种与双亲的11对SSR引物,其中5个引物对其中6个杂交种具有特异带型,进一步结合其它引物可将杂交种中混杂的其它11个品种的异型株鉴别出来。通过对照12个甜瓜杂交种的51份样品,分子标记检测纯度的结果与田间纯度鉴定的结果进行验证,利用统计学的方法对SSR指纹检测的结果与田间地里植株的形态性状鉴定的结果进行了显著性分析,结果证明,SSR分子标记技术检测技术体系可以取代地里经典的形态性状鉴定方法,用于甜瓜杂交种纯度及真实性快速鉴定。 | 李丽 张万清 刘玲 吴萍 马连平 | 2015 | 分子植物育种2015，13，11： | 16 |
| 7 | SSR分子标记技术在茄子杂交种子纯度鉴定中的应用显示文摘利用SSR分子标记技术进行种子纯度鉴定是一种准确快速、简单高效的方法。试验选用100对引物在鄂茄子2号亲本间进行PCR扩增,从中筛选出的3对引物SM17、SM29、SM51在双亲本间能够扩增出差异互补的条带。利用这3对引物对鄂茄子2号杂种一代群体进行纯度鉴定,鉴定结果为97.1%;与同批次种子的田间鉴定结果(96.1%,鉴定地点海南岛)接近,说明应用SSR分子标记技术实施茄子杂种一代种子的纯度鉴定是可行的。 | 张敏 谈太明 徐长城 谈杰 黄树苹 王春丽 | 2013 | 湖北农业科学2013，52，8： | 15 |
| 8 | DNA分子标记在作物杂交种纯度鉴定中的应用显示文摘作物杂交种的纯度鉴定是实现植物新品种保护及种子商品化生产的关键技术环节,对农业生产的经济效益和社会效益具有重要影响。本文全面的归纳了近年来DNA分子标记技术在作物杂交种纯度鉴定中应用,并具体分析了RAPD、SSR、AFLP、SARP、In Del和SNP等分子标记技术在杂交种纯度鉴定中的特点,显示其在作物杂交种的纯度检测上的广阔应用前景。 | 林春晶 张春宝 董英山 | 2015 | 分子植物育种2015，13，3： | 15 |
| 9 | 利用EST-SSR标记鉴定大白菜杂交种纯度的研究显示文摘利用EST-SSR分子标记技术,选用自主开发的3对EST-SSR引物,对13个大白菜品种的总DNA进行了PCR扩增。结果表明:EST-SSR标记可以体现品种内的一致性、亲本间以及品种间的多态性,具有共显性、稳定性和可重复性的特点;EST-SSR标记可以快速、准确地鉴别大白菜品种的真实性和杂交种纯度,为大白菜种子质量的高效检测提供科学依据。 | 张庶 周新成 李利斌 刘立锋 李化银 宋梅芳 高建伟 高玲 | 2010 | 天津农业科学2010，16，6： | 14 |
| 10 | 毛竹EST资源SSR标记分析与筛选显示文摘对来源于NCBI公共数据库的非冗余3087条毛竹(Phyllostachys edulis)EST序进行简单重复序列SSR搜索发现:在401条毛竹EST序列中共查找到408个SSR位点,平均6.8kb EST序列中含有1个SSR。其中二核苷酸和三核苷酸重复是毛竹EST-SSR的主要重复类型,分别占SSR总数的43.14%和49.75%。SSR的不同重复基序中,最常见的重复基序是:(AG)n,占37.01%,其余出现频率较高的依次为(TC)n、(AGC)n、(GAG)n和(CGC)n。根据搜索结果设计了182条毛竹EST-SSR引物,以12个不同种属的竹子DNA为模板,对引物进行了稳定性、通用性的验证与评价。结果表明有42对引物有较清晰且稳定的目标扩增产物,其中39对引物的产物存在多态性,说明设计开发的毛竹的EST-SSR标记是可行且有效的。 | 张智俊 管雨 杨丽 余利 罗淑萍 | 2011 | 园艺学报2011，38，5： | 13 |
| 11 | 利用黄秋葵转录组信息挖掘SSR标记及用于种质分析显示文摘通过对黄秋葵(Hibiscus esculentus L.)转录组信息分析,共获得74 600条unigene,全部序列有52 976 011 bp;有3 191条unigene包含SSR的序列,从中鉴定出3 448个SSR位点,其中有235条序列包含1个以上SSR,复合SSR有123个。优势重复基序为三核苷酸和二核苷酸,分别占总SSR的60.79%和21.43%。二核苷酸重复基元中以AG/CT为优势重复基元,占总位点的11.02%,三核苷酸重复基元以AGA/TCT为主,占总位点的19.61%。利用Primer 3.0共设计出8 088对SSR引物。从87对有效扩增引物中随机选择60对用于32份黄秋葵种质的多态性验证分析,其中36对(占60%)引物表现稳定可重复的多态性。利用UPGMA作图,将32份供试材料分为2类。利用黄秋葵转录组数据进行SSR标记开发,能获得较高频率的SSR位点,且类型丰富,为其遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更丰富可靠的标记选择。 | 李永平 刘建汀 陈敏氡 张前荣 朱海生 温庆放 | 2018 | 园艺学报2018，45，3： | 13 |
| 12 | 大白菜品种鉴定的SSR核心引物筛选及其应用显示文摘为筛选出一套大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)的核心引物,以54份大白菜骨干自交系为材料,从已发表的2 129对白菜SSR引物中,初步筛选出分布于白菜整个基因组、具有唯一扩增位点、扩增稳定性及重复性好的多态性SSR引物51对。进一步根据引物的多态性信息量(PIC)、等位基因数量、位点的物理位置和主成分分析(PCA)等分析结果,确定了一套包含28对SSR引物的核心引物组合。比较核心引物组合、51对多态性SSR引物和123个标记(72个SNP标记与51对多态性SSR引物)对54份大白菜骨干自交系的聚类分析结果,三者具有较高的一致性;该套引物可将262份大白菜高代自交系区分开,具有较好的鉴别能力。利用这套核心引物构建了242份大白菜品种的指纹图谱。该研究获得的28对SSR引物可以用于大白菜的遗传多样性分析和品种核酸指纹库构建等研究,可为大白菜新品种的特异性、一致性、稳定性检测体系的建立和新品种保护提供技术支持。 | 隋光磊 于拴仓 杨金雪 汪维红 苏同兵 张凤兰 余阳俊 张德双 赵岫云 | 2014 | 园艺学报2014，41，10： | 11 |
| 13 | SSR分子标记技术在汉青一号萝卜种子纯度鉴定中的应用显示文摘选用120对引物在汉青一号萝卜(Raphanus sativus L.cv.Han Qing NO.1)亲本间进行PCR扩增,从中筛选出3对引物10、30、63,在双亲本间能够扩增出差异互补的条带,利用3对引物对汉青一号萝卜杂种1代群体进行纯度鉴定。鉴定结果纯度为95.1%,与同批次种子的田间鉴定结果 96.0%相近,说明应用SSR分子标记技术实施萝卜杂种1代种子的纯度鉴定是可行并可靠的。 | 张小康 朱运峰 陈玉霞 徐长城 张雪丽 熊秋芳 | 2016 | 湖北农业科学2016，55，19： | 10 |
| 14 | 大白菜高通量SSR标记鉴定体系的建立和应用显示文摘大白菜是重要的蔬菜作物,准确鉴定大白菜品种对于大白菜种质资源管理、新品种测试、种子质量检测等具有重要意义。本研究从已定位到大白菜10个连锁群的205个SSR标记中,筛选出30个在连锁群上分布均匀、PCR扩增稳定、带型简单的标记,用于大白菜品种DNA指纹鉴定。对入选的引物用4种荧光染料进行了标记,利用基于毛细管电泳荧光检测的DNA分析仪对SSR扩增产物进行检测。通过比较分析2种不同型号的3台DNA分析仪的扩增片段检测数据,明确了不同DNA分析仪的检测数据间一般存在明显的系统误差。系统误差的大小取决于引物,一般在1~4 bp之间。使用扩增产物的片段长度对各SSR位点的不同等位变异进行命名。通过使用一组参照品种,消除了不同批次、不同DNA分析仪型号间的系统误差,保证了检测数据的可重复性和可再现性。在此基础上,对184份大白菜品种进行了DNA分子数据采集。 | 张晗 王东建 孙加梅 郑永胜 姚凤霞 许金芳 宋国安 段丽丽 李华 王雪梅 李汝玉 | 2014 | 植物遗传资源学报2014，15，4： | 7 |
| 15 | 基于高分辨率熔解曲线技术快速筛选黄瓜SNP_1显示文摘为筛选用以黄瓜纯度检验和品种鉴定的SNP位点,以17个黄瓜杂交品种及其34份亲本为SNP筛选群体,利用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)技术筛选SNP位点。本研究通过HRM分析和焦磷酸测序确认,获得CLA0(TT/--)、CLA1(C/T)和CLA6(A/G)三个SNP位点,群体中多态信息量(PIC)分别为0.549、0.366和0.477;并对市售12个杂交黄瓜种分型鉴定,结果表明,三个SNP位点适用于其中11个市售品种的纯度鉴定,具备用于品种鉴定的潜能。 | 兰青阔 张桂华 王永 赵新 朱珠 孙玉河 郭永泽 程奕 | 2011 | 分子植物育种2011，9，5： | 6 |
| 16 | 复合EST-SSR标记在大白菜品种鉴定中的应用显示文摘利用EST-SSR分子标记技术,对12份大白菜品种鉴定方法进行了研究。通过对GenBank数据库中公布的大白菜EST序列的分析,合成了30对核心EST-SSR引物,其中21对均可得到有效扩增,10对具有较高的多态性。为了更加高效的对大白菜品种进行鉴定,根据这10对多态性较高的引物对12份市售大白菜品种鉴定的结果及扩增条带的相互位置差异,研制了由多个引物对组成的2套复合EST-SSR标记,建立了多重SSR的反应体系及反应条件。筛选得到的2套标记组合,多态率分别为88.9%和97.0%,多态信息量均为0.910%,数据表明这2套复合标记技术可以表达大白菜品种间的多态性,高效准确的对12份大白菜品种进行鉴定。 | 赵新 王永 兰青阔 陈锐 李欧静 余景会 朱珠 郭永泽 | 2013 | 生物技术通报2013，29，1： | 5 |
| 17 | 花椰菜EST-SSR反应体系的优化显示文摘为获得花椰菜EST-SSR优化扩增体系,本研究以‘喜美’花椰菜为材料,采用单因素试验对EST-SSR反应体系的Mg2+、d NTP、Taq酶、引物和DNA浓度分别进行优化。研究结果表明,花椰菜EST-SSR25μL优化反应体系为:2.5μL 10×Buffer,2.0 mmol/L Mg2+,0.2 mmol/L d NTP,1 U Taq酶,0.56 mmol/L引物,100 ng DNA。利用该反应体系,选用引物EST529-1在10个花椰菜品种中进行优化反应体系的验证。结果显示扩增产物条带清晰明亮、多态性丰富且特异性强、重复性好,表明本研究所确定的反应体系适用于花椰菜的EST-SSR分子标记。 | 林珲 朱海生 陈敏氡 王彬 温庆放 吴卫东 | 2015 | 分子植物育种2015，13，11： | 5 |
| 18 | 辣椒品种‘豫椒101’纯度鉴定的SSR标记筛选显示文摘本研究以辣椒品种‘豫椒101’及其亲本为试验材料,用SSR标记技术研究杂交种与双亲之间的扩增条带多态性以甄别真假杂交种。结果发现,从64对SSR引物中筛选到2对在亲本间差异明显、在杂交种表现为双亲互补带型的引物,分别为CA08g16130和CA02g22780,很适合做杂交种纯度鉴定。用该2个标记对188株‘豫椒101’杂交种进行纯度分析,结果表明,CA08g16130所测纯度为93.6%,CA02g22780鉴定的杂交种纯度为94.1%,179个单株的鉴定结果一致,一致率达到95.2%。因此,筛选出的2个SSR标记可以用于辣椒杂交种‘豫椒101’种子纯度的快速鉴定。 | 杨双娟 于文涛 原玉香 魏小春 王志勇 赵艳艳 姚秋菊 张晓伟 | 2019 | 分子植物育种2019，17，22： | 4 |
| 19 | 基于SSR标记的49个大白菜自交系遗传多样性分析显示文摘利用扩增条带清晰且覆盖白菜10个连锁群的33个SSR标记分析了49个大白菜自交系的遗传多样性。结果表明,22对引物在供试材料间表现多态,11对引物表现单态扩增,多态引物频率达到66.7%,其中A1、A3、A8和A9连锁群上多态引物比例相对较高。多态引物共扩增出68个等位变异,每个位点2-8个,平均3.09个;不同引物的多态性信息含量0.05-0.88,平均0.48;品种间的遗传距离变异为0-0.93,所有成对遗传距离的平均值为0.51,UPGMA聚类结果与品种间亲缘关系及其农艺特征有较好的一致性。 | 原静云 李小军 任翠翠 原连庄 | 2016 | 河南农业科学2016，45，11： | 4 |
| 20 | EST-SSR标记在蔬菜作物中的开发和应用进展显示文摘EST-SSR标记是根据表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)序列而开发的新型分子标记,与传统的基因组SSR相比具有开发费用相对较低、快捷获取基因表达信息、物种间通用性好等突出优点,尤其适用于未完成基因组测序的作物。本文对近年来蔬菜作物中EST-SSR标记的开发和应用进展进行了简述与展望,以期推动EST-SSR标记在蔬菜作物中的进一步应用。 | 吴海滨 罗少波 罗剑宁 龚浩 何晓莉 | 2012 | 中国蔬菜2012，，04X： | 4 |
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