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| 1 | 花生中低温胁迫相关转录因子基因的筛选显示文摘为了研究花生低温胁迫下的基因表达调控机理,以花生花育19为材料,通过低温处理后芯片杂交实验,筛选花生叶片中低温胁迫响应转录因子基因。结果表明,175个具有转录调控活性的基因在低温胁迫的花生叶片中表达变化量达到2倍以上,其中92个为上调基因,83个为下调基因。通过基因功能分类分析发现,这些基因中53个上调基因和46个下调基因编码转录因子。进一步分析发现,参与花生低温抗性调控的转录因子主要包括MYB、WRKY、NAC及AP2/ERF等家族蛋白。此外,一些不包含已知保守结构域的转录因子也参与了花生低温抗性调控。本研究为花生低温抗性调控研究提供了新的转录因子基因资源。 | 陈娜 迟晓元 程果 潘丽娟 陈明娜 王通 王冕 杨珍 禹山林 | 2016 | 核农学报2016，30，1： | 12 |
| 2 | Genome-wide Analysis of MYB Gene Family in Potato Provides Insights into Tissue-specific Regulation of Anthocyanin Biosynthesis显示文摘The MYB transcription factor is one of the largest gene families in plants,playing an important role in regulating plant growth,development,response to stress,senescence,and especially the anthocyanin biosynthesis.In this study,A total of 217 MYB genes,including 901R-MYBs,124 R2R3-MYBs,and 3 R1R2R3-MYBs have been identified from the potato genome.The 1R-MYB and R2R3-MYB family members could be divided into 20 and 35 subgroups respectively.Analysis of gene structure and protein motifs revealed that members within the same subgroup presented similar exon/intron and motif organization,further supporting the results of phylogenetic analysis.Potato is an ideal plant to reveal the tissue-specific anthocyanins biosynthesis regulated by MYB,as the anthocyanins could be accumulated in different tissues,showing colorful phenotypes.Five pairs of colored and colorless tissues,stigma,petal,stem,leaf,and tuber flesh,were applied to the transcriptomic analysis.A total of 70 MYB genes were found to be differentially expressed between colored and colorless tissues,and these differentially expressed genes were suspected to regulate the biosynthesis of anthocyanin of different tissues.Co-expression analysis identified numerous potential interactive regulators of anthocyanins biosynthesis,involving 39 MYBs,24 bHLHs,2 WD-repeats,and 29 biosynthesis genes.Genome-wide association study(GWAS)of tuber flesh color revealed amajor signal at the end of Chromosome 10,which was co-localized with reported I gene(StMYB88),controlling tuber peel color.Analyses of DEGs(Differentially Expression Genes)revealed that both StMYB88 and StMYB89 were closely related to regulating anthocyanin biosynthesis of tuber flesh.This work offers a comprehensive overview of the MYB family in potato and will lay a foundation for the functional validation of these genes in the tissue-specific regulation of anthocyanin biosynthesis. | Yumei Li Jun Liang Xiangzhi Zeng Han Guo Youwei Luo Philip Kear Shouming Zhang Guangtao Zhu | 2021 | Horticultural Plant Journal2021，7，2： | 8 |
| 3 | 黄瓜果实CsMYB62克隆及其对CsGR-RBP3表达的调控显示文摘本研究前期证实,低温诱导的CsGR-RBP3表达与黄瓜果实耐冷性密切相关,但调控其表达的具体机理尚不清楚。为鉴定调控CsGR-RBP3表达的MYB转录因子,本研究采用转录组测序,分析了黄瓜果实在5℃低温处理后的转录组变化,并通过共表达趋势分析,鉴定了与CsGR-RBP3表达趋势一致的MYB基因。结果发现,CsMYB62与CsGR-RBP3表达的相关性很高,且低温处理能诱导黄瓜果实CsMYB62和CsGR-RBP3表达,推测CsMYB62转录因子可能调控CsGR-RBP3表达。为进一步分析CsMYB62基因的功能,从黄瓜果皮中克隆了CsMYB62基因全长序列。结果显示,CsMYB62基因全长834 bp,编码277个氨基酸残基。CsMYB62蛋白含有SANT保守域和MYB DNA结合域,定位在细胞核,在进化过程中高度保守。CsMYB62蛋白具有转录激活活性,能直接绑定到CsGR-RBP3启动子,增强CsGR-RBP3启动子活性,表明CsMYB62通过直接调控CsGR-RBP3表达而增强黄瓜果实耐冷性。本研究结果丰富了MYB调控网络,为进一步解析CsMYB62功能奠定了理论基础。 | 王斌 武春爽 汤冰琳 王光 何金明 曲姗姗 朱世江 | 2022 | 核农学报2022，36，5： | 5 |
| 4 | 杨树MYB基因应答非生物胁迫的表达特性显示文摘MYB转录因子以其含有的保守MYB结构域为特征,是植物转录因子中数量最多的家族之一,广泛参与植物生长发育和代谢的调节。利用生物信息学分析获得222条杨树MYB基因,用实时定量PCR筛选出8条对盐胁迫有强烈应答的基因,研究其在盐、干旱、ABA等非生物胁迫下的表达模式;结果表明:这8条MYB基因虽然在杨树根、茎、叶组织中均有表达,但是在不同胁迫条件和不同组织中的表达水平明显不同。在盐和干旱胁迫条件下,8个基因在根、茎、叶中均被诱导表达,表现为相似的表达模式。在ABA处理条件下,而多数基因无明显应答。说明杨树MYB基因在应答环境变化与激素调节中具有不同的作用,并且在不同组织中的作用有所差异。 | 冯波 朱腾飞 张弛 董博 周博如 | 2017 | 东北林业大学学报2017，45，4： | 4 |
| 5 | 沙冬青响应非生物胁迫的转录因子基因鉴定与分析显示文摘以沙冬青[Ammopiptanthus mongolicus(Maxim.ex Kom.)Cheng f.]幼苗为实验材料,对其转录组进行测序,筛选出质量体积分数18%聚乙二醇6000模拟干旱胁迫下差异表达的转录因子基因;在此基础上,对干旱胁迫下差异表达bHLH转录因子的系统进化关系以及干旱胁迫和100 mmol·L^(-1)NaCl胁迫下差异表达bHLH基因的表达模式进行分析。结果表明:沙冬青中存在49个转录因子基因家族,共包含1 575个转录因子基因。干旱胁迫下沙冬青地上部有44个转录因子基因表达量的差异倍数大于等于2倍,其中33个转录因子基因上调表达,11个转录因子基因下调表达;地下部有57个转录因子基因表达量的差异倍数大于等于2倍,其中50个转录因子基因上调表达,7个转录因子基因下调表达。沙冬青响应干旱胁迫的差异表达转录因子基因主要分布于AP2-EREBP、MYB、WRKY、NAC和bHLH基因家族。沙冬青地上部和地下部表达量上(下)调2~5、5(含5)~10(含10)及10倍以上的差异表达转录因子基因数分别为28、7和9个,以及11、27和19个。聚类分析结果显示:沙冬青6个差异表达bHLH基因编码的氨基酸序列与拟南芥[Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.]bHLH基因编码的氨基酸序列有不同程度的相似性。干旱胁迫和NaCl胁迫下,沙冬青6个差异表达bHLH基因的表达受到不同程度的诱导。本结果为研究非生物胁迫过程中沙冬青调控机制提供了大量的转录因子基因资源。 | 金曼 苏彦华 | 2018 | 植物资源与环境学报2018，27，1： | 3 |
| 6 | 甘薯基因组R2R3-MYB转录因子鉴定与分析显示文摘MYB是植物中数量众多且功能重要的转录因子家族。本研究通过生物信息学方法从未经注释的甘薯全基因组序列中筛选鉴定出MYB家族基因,分析了R2R3-MYB类基因的结构与功能。结果发现,甘薯基因组中含有R2R3-MYB转录因子基因88个,均含有完整的R2、R3保守结构域,且R2、R3保守结构域中分别含有8个和9个高度保守的碱性氨基酸。MEME分析结果表明,甘薯R2R3-MYB蛋白序列中含有10个保守基序,其中80%以上的R2R3-MYB序列中含有motif 1、motif 2、motif 3、motif 4、motif 5以及motif 7;利用circos软件定位R2R3-MYB序列在染色体上的分布情况,发现甘薯88个R2R3-MYB基因不均匀分布在15条染色体上,其中5号染色体上数量最多,达15个,4号和13号数量最少,仅2个,经序列比对分析,发现它们在染色体内和染色体间均存在复制关系,其中存在于染色体间潜在复制关系的基因有6对,染色体内有20对,且这20个基因对中有19对在染色体上成簇状分布。经序列功能预测与归类,有44个R2R3-MYB转录因子基因可归入拟南芥R2R3-MYB基因分类的13个亚组中,分别参与响应生物与非生物胁迫、花青素合成、花药发育等途径。进一步分析发现,甘薯中有36个R2R3-MYB转录因子基因可能在响应生物和非生物胁迫上发挥重要功能,其中9个基因在尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum f.sp.batatas,Fob)胁迫下表达量出现明显上调/下调变化,27个在低温胁迫下表达量出现明显上调/下调变化。甘薯R2R3-MYB转录因子结构域高度保守,R2和R3结构域中均含有较高的保守基序;进化树及转录组测序分析显示部分基因可能参与植物生长发育、代谢调控以及生物与非生物胁迫等途径,可为甘薯抗性育种提供参考。 | 黄小芳 毕楚韵 黄碧芳 许明 杨志坚 林世强 陈选阳 | 2021 | 分子植物育种2021，19，21： | 2 |
| 7 | 黄瓜CsPYCR的克隆及生物信息学分析显示文摘本研究以黄瓜低霜霉威残留品系‘D0351’为材料,克隆了在霜霉威胁迫后上调表达的基因Cs PYCR,并采用生物信息学方法对该基因进行分析,以明确该基因在降低黄瓜果实内霜霉威残留过程中的作用机制,为下一步通过遗传转化试验鉴定基因功能提供理论基础。结果表明:该基因全长831 bp,编码276个氨基酸,属于PLN02688蛋白家族。该基因编码的蛋白质有可能为细胞质中的疏水蛋白质,无明显信号肽,无跨膜结构。与甜瓜(XM_008457466.2)同源性较高。该基因启动子中包括与乙烯、脱落酸等激素相关的顺式作用元件以及防御和应激反应相关的顺式作用元件,且含有多个与逆境胁迫相关的MYB家族蛋白转录因子结合位点,推测其可能在降低黄瓜霜霉威农药残留过程中发挥重要作用。 | 王天恩 李奇峰 文云红 尹茵 盛云燕 李丹丹 萨日娜 张帆 | 2023 | 分子植物育种2023，21，24： | 0 |
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