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| 1 | 牦牛体外成熟卵母细胞差异转录组学研究显示文摘卵母细胞体外成熟环节是现代繁殖育种技术的基础环节,体外成熟的MⅡ期卵母细胞的质量直接影响了卵母细胞的后续受精及受精卵卵裂.由于卵母细胞的发育成熟是一个涉及大量基因转录调控的复杂过程.因此,转录组学研究是了解卵母细胞发生发育的关键.本研究以高海拔地区的特有牛属动物牦牛(Bos grunniens)卵母细胞作为研究对象,应用RNA-seq技术对牦牛GV期卵母细胞及体外成熟MⅡ期卵母进行转录组学测序及比对分析.经深度测序后,各获得一个包含51380686条过滤测序序列(cleanreads),4624261740碱基(bp)的GV期牦牛卵母细胞测序文库和一个包含50303412条过滤测序序列(clean reads),4527307080碱基(bp)的MⅡ期牦牛卵母细胞测序文库.基因覆盖率统计表明,GV期和MⅡ期文库中分别有16719条和16339条牦牛基因得到转录.通过比较分析MⅡ和GV期转录组数据,共筛选出4767个差异表达基因,其中1418个基因表达量上调和3349个基因表达量下调.GO功能分类注释显示,差异基因与'代谢过程'等生物学过程存在密切关联,同时结合分子功能相关类别等分子事件表现活跃.按表达量上调和下调分别对差异基因进行KEGG通路互作分析,结果表明,凋亡通路、内吞通路及代谢通路是上调的关键调控通路,而代谢通路、丙酮酸代谢、黏着斑及氧化磷酸化是下调的关键调控通路,其中代谢通路在上调及下调通路互作中均起关键调控作用.进一步对代谢通路进行分析,结果表明,组氨酸代谢、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、乙醛酸和二羧酸代谢及谷胱甘肽代谢是整个代谢通路的关键调控节点。此外,本研究发现,在牦牛卵母细胞体外成熟过程中,与免疫相关的白细胞介素家族及干扰素家族基因发生了显著差异表达.该研究结果为进一步解析牦牛卵母细胞发育的分子机制及全面了解牦牛繁殖的特异性提供了基础. | 兰道亮 熊显荣 陈亚冰 泽让东科 艾鷖 李键 | 2017 | 中国科学:生命科学2017,47,10: | 7 |
| 2 | 沼液回流时间对厨余垃圾高含固厌氧发酵的影响显示文摘研究了高温(55±2)℃下沼液回流时间(1,6,12,24 h/d)对厨余垃圾高含固(15%TS)厌氧发酵产氢的影响,并探讨了不同沼液回流时间下微生物群落的演替规律。结果表明:增加沼液回流时间可提高产氢量,缓解VFAs积累的抑制效应,回流时间为24 h/d时氢气累积产量最大,为111.44 L,VFAs浓度为28.34 g/L,比回流时间1 h/d时降低了15.40%。厨余垃圾厌氧发酵过程中延长回流时间可恢复酸化体系的pH,且未形成氨积累。回流时间较短(12 h/d)的S实验组中,随着发酵的进行,微生物群落结构多样性降低,在门水平上Firmicutes逐渐演替为优势菌(49.2%~89.5%),回流时间较长(24 h/d)的T实验组一直保持较高的微生物多样性,发酵结束时,Firmicutes、Chloroflexi、Proteobacteria、Euryarchaeota相对丰度分别为27.8%、33.6%、13.0%和12.3%;属水平上T实验组(24 h/d)的产氢菌相对丰度高于S实验组(12 h/d),发酵结束时产氢菌Clostridium和Thermoanaerobacterium的相对丰度分别为10.5%和3.2%。延长沼液回流时间可促进VFAs与葡萄糖代谢产氢。冗余分析表明,沼液回流时间和产气量主要与Firmicutes和Chloroflexi中菌属变化较明显相关。 | 任安东 郑义 孙天姿 赵丽雅 王攀 任连海 | 2021 | 环境工程2021,39,12: | 4 |
| 3 | An ab initio investigation of vibrational, thermodynamic, and optical properties of Sc_2AlC MAX compound显示文摘The structural vibrational, thermodynamical, and optical properties of potentially technologically important, weakly coupled MAX compound, Sc2 Al C are calculated using density functional theory(DFT). The structural properties of Sc_2AlC are compared with the results reported earlier. The vibrational, thermodynamical, and optical properties are theoretically estimated for the first time. The phonon dispersion curve is calculated and the dynamical stability of this compound is investigated. The optical and acoustic modes are observed clearly. We calculate the Helmholtz free energy(F), internal energy(E), entropy(S), and specific heat capacity(Cv) from the phonon density of states. Various optical parameters are also calculated. The reflectance spectrum shows that this compound has the potential to be used as an efficient solar reflector. | M A Ali M T Nasir M R Khatun A K M A Islam S H Naqib | 2016 | Chinese Physics B2016,25,10: | 1 |
| 4 | 哺乳动物卵母细胞及早期胚胎蛋白质组学研究进展显示文摘雌性生殖细胞发育是动物繁殖的基石,哺乳动物卵母细胞和早期胚胎在其生长发育过程中有许多独特的现象和规律,涉及一系列蛋白质合成/降解和磷酸化等状态的动态改变。对卵母细胞分裂、成熟调控机理以及植入前胚胎发育规律的研究是发育生物学领域的一项重要课题。蛋白质组学是以细胞或组织内全部的蛋白质为研究对象,系统鉴定、定量蛋白质并研究这些蛋白质功能的科学。随着蛋白质分离、鉴定技术的快速发展,蛋白质组学为卵母细胞发生、分化、成熟以及质量控制等相关研究提供了新的方法和内容,如在蛋白质定量、修饰、定位和相互作用等方面提供其他组学技术不可获得的重要信息。这些信息将有助于揭示哺乳动物卵母细胞成熟和早期胚胎发育的分子机制,对于进一步完善卵母细胞的体外成熟培养体系,提高胚胎体外生产、体细胞克隆和转基因动物生产效率具有重要意义。 | 陈凌声 徐平 石德顺 李湘萍 | 2014 | 生物工程学报2014,30,7: | 1 |
| 5 | 水牛孤雌激活早期胚胎蛋白质表达谱的构建及生物信息学分析显示文摘收集水牛孤雌激活后2细胞期早期胚胎500枚,利用0.1%链酶蛋白酶去除透明带后提取蛋白质,并使用胰蛋白酶进行酶解处理,再将酶解得到的多肽混合物经强阳离子交换色谱进行顸分离,预分离后所收集的馏分通过液相色谱串联质谱(LC—MS/MS)技术进行质谱鉴定,原始数据通过数据库搜索获得该时期蛋白质表达谱0通过SE-QUEST检索共得到778种蛋白,对其进行生物信息学初步分析,包括G0富集分析和蛋白互作网络分析等。结果发现,这些蛋白质主要参与氧化还原、蛋白质折叠、细胞内蛋白质运输等生物学过程,主要定位于线粒体和细胞膜上。本研究为后续以孤雌激活为研究模型探讨哺乳动物早期胚胎发育和母源性蛋白质调控机制提供了新的研究手段和方法。 | 陈富美 濮黎萍 付强 王焕景 张鹏飞 候振 徐壮壮 黄凤玲 陆阳清 张明 | 2018 | 中国兽医学报2018,38,6: | 0 |
| 6 | Novel assay for identification of semicarbazide-sensitive amine oxidase by a priority-based strategy in mass spectrometry显示文摘A novel assay for the identification of semicarbazide-sensitive amine oxidase in human umbilical artery tissue by a priority-based strategy in the mass spectrometry was developed.The protein extract was separated by SDS-PAGE,and then an entire band at 96KDa was excised and digested by trypsin.The digested peptides were separated by capillary C18 analytical column and detected by ESI-MS-MS.In the direct data-dependent method(also called traditional method),the semicarbazide-sensitive amine oxidase(SSAO)cannot be identified by LC-ESI-MS-MS.Compared with the traditional method,our assay by a priority-based strategy in the mass spectrometry can successfully identify the target protein-SSAO in the complex biological sample.As 60μg,120μg,240μg of total protein extract were loaded on the SDS-PAGE,the Mascot result showed that SSAO score was 46,86 and 137,the sequence coverage was 2%,5% and 10%,and the peptide count was 2,6 and 10,respectively.The MS/MS spectra of two unique peptides of SSAO were confirmed by manual identification.The band at 96 KDa included SSAO was validated by the Western blot.The assay significantly improved the score and coverage of target protein and enhanced the identification of reliability and the confidence. | 张永谦 王洪斌 王露 胡高飞 朱勇 邓玉林 | 2011 | Journal of Beijing Institute of Technology2011,20,1: | 0 |
| 7 | 贵金属纳米粒子修饰的核胶球复合材料的研究进展显示文摘综述了贵金属纳米粒子修饰的核胶球材料的研究进展。由于贵金属壳-胶球核复合材料具有高的稳定性和优异的光学、催化等性质,是当前材料科学研究领域的一个热点。因此,发展简单的、大量的制备这种复合材料的方法,以及广泛深入地研究其性能和应用具有十分重要的意义。 | 周晓光 田春贵 王霆 廖丽霞 | 2010 | 应用化学2010,27,4: | 0 |
| 8 | RNA结合蛋白Rbpms 2在小鼠卵母细胞及早期胚胎中的表达及意义显示文摘目的:检测分析多重剪接RNA结合蛋白2(RNA binding protein with multiple splicing 2,Rbpms2)在小鼠卵母细胞及早期胚胎中的表达及分布情况。方法:运用生物信息学资源分析Rbpms2基因表达的组织分布情况以及Rbpms2蛋白的功能结构域;通过免疫印迹法、免疫组织化学及免疫荧光检测,分析Rbpms2在小鼠卵母细胞及早期胚胎中的表达和分布。结果:生物信息学检索显示Rbpms2 mRNA在卵细胞及受精卵中高表达,其蛋白具有一个RNA识别结构域。免疫印记法证实Rbpms2蛋白在小鼠卵母细胞中高表达,同时免疫组织化学显示阳性信号主要集中在卵母细胞胞质中,免疫荧光显示在早期胚胎中,Rbpms2的信号集中在细胞核中。结论:Rbpms2在小鼠卵母细胞及早期胚胎中呈高水平表达,提示其可能在卵母细胞和早期胚胎的发育过程中发挥重要作用。 | 崔婷 张平 郭雪江 霍然 毕晔 | 2011 | 生殖与避孕2011,31,11: | 0 |