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| 1 | Combining proteomics, serum biomarkers and bioinformatics to discriminate between esophageal squamous cell carcinoma and pre-cancerous lesion显示文摘Objective: Biomarker assay is a noninvasive method for the early detection of esophageal squamous cellcarcinoma (ESCC). Searching for new biomarkers with high specificity and sensitivity is very important for the earlydetection of ESCC. Serum surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry(SELDI-TOF-MS) is a high throughput technology for identifying cancer biomarkers using drops of sera. Methods: Inthis study, 185 serum samples were taken from ESCC patients in a high incidence area and screened by SELDI. Asupport vector machine (SVM) algorithm was adopted to analyze the samples. Results: The SVM patterns success-fully distinguished ESCC from pre-cancerous lesions (PCLs). Also, types of PCL, including dysplasia (DYS) and basalcell hyperplasia (BCH), and healthy controls (HC) were distinguished with an accuracy of 95.2% (DYS), 96.6% (BCH),and 93.8% (HC), respectively. A marker of 25.1 kDa was identified in the ESCC patterns whose peak intensity wasobserved to increase significantly during the development of esophageal carcinogenesis, and to decrease obviously after surgery. Conclusions: We selected five ESCC biomarkers to form a diagnostic pattern which can discriminateamong the different stages of esophageal carcinogenesis. This pattern can significantly improve the detection ofESCC. | Xiao-hui ZHAI Jie-kai YU Chen LIN Li-dong WANG Shu ZHENG | 2012 | Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)2012，13，12： | 9 |
| 2 | 基于SELDI-TOF-MS技术筛选乳腺癌血清蛋白标志物显示文摘目的筛选并鉴定乳腺癌患者血清中可能存在的蛋白标志物,建立与乳腺癌早期诊断及三阴性乳腺癌相关的蛋白质指纹图谱模型。方法分别收集60例乳腺癌患者术前及对应术后2周的血清标本,其中包括22例三阴性乳腺癌患者。采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选出乳腺癌术前组与健康对照组、乳腺癌术前组与术后组、三阴性乳腺癌组与非三阴性乳腺癌组之间血清差异蛋白,然后联合MALDI-TOF-MS、Tricine-SDS-PAGE等技术对筛选出的目标蛋白进行鉴定,最终确定乳腺癌血清特异蛋白标志物。结果乳腺癌术前组与健康对照组共筛选到14个差异蛋白峰值,11个在乳腺癌组呈高表达,3个呈低表达,其中Youden指数最高的模型为低表达蛋白m/z6448。乳腺癌组m/z6448表达水平低于健康对照组(38.0187±34.2194vs 337.5261±507.6438,P<0.01)。乳腺癌术前组与术后组具有差异性的蛋白质峰值6个,其中有4个在乳腺癌术前组呈高表达,有2个低表达。Youden指数最高的模型为m/z6448,其在乳腺癌术后组的表达水平高于术前组(38.0187±34.2194vs 294.1245±102.8634,P<0.01)。三阴性乳腺癌组与非三阴性乳腺癌组筛选出9个差异性的蛋白质峰值,其中有4个在三阴性乳腺癌组低表达,Youden指数最高的模型m/z峰位于6448的蛋白标志物,其在非三阴性乳腺癌中表达水平高于三阴性乳腺癌(5.1351+3.6437vs 43.6162±185.8542,P<0.01)。联合MALDI-TOF-MS、Tricine-SDSPAGE等技术对筛选出的目标蛋白质进行鉴定,最终确定该差异蛋白为载脂蛋白C-I(APO C-I)肽段。结论 m/z峰位于6448的蛋白标志物经鉴定为载脂蛋白C-I肽段,可以作为乳腺癌血清尤其是三阴性乳腺癌的特异性血清蛋白标记物,初步建立了乳腺癌早期诊断及三阴性乳腺癌血清蛋白质指纹图谱模型。该蛋白表达的降低与乳腺癌肿瘤恶性程度的升高相关,可能与乳腺癌较差的预后有关,值得更深入研究。 | 孙亚冬 王家祥 崔树德 | 2019 | 中国实验诊断学2019，0，9： | 6 |
| 3 | 肺结核病人血清差异蛋白的分离及鉴定显示文摘目的分离并鉴定SELDI筛选出的肺结核病人血清差异表达蛋白。方法乙腈沉淀法去除血清中的高丰度蛋白,Tricine-SDS-PAGE电泳分离差异表达的目标蛋白,高效液相色谱串联质谱鉴定目标蛋白并进行生物信息学分析。结果电泳显示肺结核患者血清中小于6000Da的蛋白条带浓度明显低于正常人血清,经质谱鉴定和生物信息学分析,该目标蛋白为载脂蛋白(apo)C-I酶解片段,与SELDI建立的诊断模型中分子量为M4480.14的潜在标志物吻合。结论与血脂代谢密切相关的apo C-I可能是结核病血清潜在标志物之一。 | 李翠萍 胡天桥 农炳金 臧宁 周怡 胡水秀 郑艳燕 周昌明 何敏 | 2012 | 中国实验诊断学2012，16，9： | 2 |
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