| 1 | 萝卜ARGOSs基因的克隆及表达分析显示文摘本研究利用RT-PCR方法从萝卜(Raphanus sativus)中分离了ARGOS基因的同源基因RsARGOS1和RsARGOS2,并对其表达模式进行了分析。结果表明,RsARGOS1基因预测编码133个氨基酸,RsARGOS2基因预测编码109个氨基酸。RsARGOS1在所有器官中均表达,其中肉质根中表达量最高,叶中表达量最低;RsARGOS2基因在花蕾中表达量最高,花序轴中的表达量最低。RsARGOSs基因表达受到激素的调节,RsARGOS1基因的表达量在喷施6-BA后明显增高,6小时左右达到顶峰,喷施NAA的影响不大;RsARGOS2基因的表达同时受NAA和6-BA的诱导,NAA的诱导幅度大于6-BA。上述研究结果对理解RsARGOSs基因参与调控萝卜的生长发育过程具有重要参考价值。 | 张一卉 王彬 李化银 王淑芬 高玲 王凤德 高建伟 | 2014 | 山东农业科学2014，46，10： | 1 |
| 2 | 谷子SiARGOS1的克隆、表达分析和功能标记开发显示文摘【目的】从谷子中分离受激素诱导表达、参与器官大小控制的拟南芥ARGOS(Auxin-regulated gene involved in organ size)基因家族的同源基因,进行生物信息学分析,明确其在不同组织器官及其受植物激素诱导的表达模式,分析基因编码区及其启动子序列差异,开发功能标记,为谷子产量性状相关基因的改良提供依据。【方法】通过对已有ARGOS蛋白保守结构域进行BLAST,明确谷子ARGOS家族成员数目并进行蛋白序列分析,采用同源克隆方法获得谷子ARGOS家族成员之一——SiARGOS1编码区及其启动子序列,用生物信息学方法分析SiARGOS1启动子的顺式作用元件,通过实时荧光定量PCR分析该基因在谷子各器官中以及不同植物激素条件下的诱导表达模式,利用基因编码区及启动子序列的SNP和插入缺失序列开发分子标记,同时利用85份谷子品种的穗重(panicle weight,PW)、穗粒重(grain weight,GW)和千粒重(thousand-grain weight,TGW)等产量性状数据进行基因型间的差异显著性分析,挖掘用于检测该基因与谷子产量性状相关优异等位变异的功能标记。【结果】获得6个谷子ARGOS家族成员,均具有典型的保守OSR(organ size related)结构域,包含2个跨膜螺旋结构和1个高度保守富含亮氨酸区域,克隆了与拟南芥AtARGOS同源的家族成员之一——SiARGOS1编码区及其启动子序列,该基因位于谷子第8染色体上,开放阅读框为342 bp,无内含子,编码113个氨基酸,启动子区域为2 109 bp,含有与生长素、乙烯、茉莉酸和赤霉素等多种植物激素调控有关的元件。表达分析发现,SiARGOS1在谷子根、茎、叶和穗等器官中均有表达,在根中表达量最高,其次为茎和叶,穗中表达量最低。SiARGOS1对生长素吲哚乙酸(indole-3-acetic acid,IAA)不敏感,但受乙烯利(ethephon,ETH)上调表达。不同基因型谷子SiARGOS1序列分析发现,SiARGOS1编码区151 bp(起始密码子83 bp)处存在1个SNP(C/G),导致该基因第28个氨基酸发生突变(Ala/Gly),据此设计一个CAPS-AccⅡ标记;另外,启动子区存在19个SNP和2个In Del,根据-1 652—-1 651处(TA)_(2/3)和-1 165—-1 163处(TCA)_(1/2)的序列差异分别设计SSR引物AP-1和AP-2。同时,用这些标记对85份谷子品种进行检测,CPAS-AccⅡ和AP-1检测到不同基因型的穗重、穗粒重和千粒重的差异均不显著,而AP-2检测的2种基因型间除千粒重差异不显著外,穗重和穗粒重在2015和2016两年间差异均达到显著水平。【结论】在谷子中发现6个ARGOS家族成员,均具有保守OSR结构域,其中,谷子SiARGOS1开放阅读框为342 bp,无内含子,与拟南芥AtARGOS同源,该基因对生长素不敏感,但受乙烯利上调表达。在该基因启动子区开发的SSR标记AP-2可作为功能标记,用于谷子穗重和穗粒重等产量性状相关优异等位变异的鉴定和筛选。 | 王智兰 杜晓芬 王军 杨慧卿 王兴春 郭二虎 王玉文 袁峰 田岗 刘鑫 王秋兰 李会霞 张林义 彭书忠 | 2017 | 中国农业科学2017，50，22： | 1 |
| 3 | 利用cDNA-AFLP技术分析‘窄冠黑白杨’杂种优势的差异表达基因显示文摘本研究以‘窄冠黑白杨’(Populus ‘Zhaiguanheibaiyang’)及其亲本为材料,通过cDNA扩增片段长度多态性分析技术(cDNA-AFLP)构建扩增图谱。从96对扩增引物中筛选出35对可用于条带分析的扩增引物,获得761个修饰位点, 5种基因差异表达模式。回收cDNA-AFLP图谱中分离的19条差异表达的转录衍生片段(transcript-derived fragments, TDFs)进行同源性比对分析,发现其中14条TDFs与杨树基因库中的已知基因同源,如丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(STPK)、泛素激活酶(E1)、糖基转移酶(UDP)、ARGOS-like蛋白基因等,在植物生长代谢活动、信号转导调控等途径中具有重要作用。利用实时荧光定量PCR技术检测差异表达TDFs在杂种及父本中芽、叶、茎等不同组织的表达量,发现在叶中表达量有明显差异,这可能与杂种优势密切相关。结果与cDNA-AFLP图谱一致,说明研究结果稳定可靠,为后续杨树杂种优势的研究提供新的见解。 | 侯丽丽 姚培娟 李际红 李景涛 李柱 | 2020 | 植物生理学报2020，56，12： | 1 |
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