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1AFLP分子标记技术及其在水产动物中的应用显示文摘AFLP分子标记技术是DNA指纹技术的重大突破,由于其快速、简便、有效,因而在医学、农业、林业、畜牧业、渔业等领域中得到了广泛的应用。近年来人们不断地将这一技术完善和发展,使得AFLP成为迄今为止最有效的分子标记。本文简述了AFLP技术的基本原理、技术流程以及在水产动物中的应用情况。姚红伟 袁霞 付鑫 景娜娜 2009现代渔业信息2009,24,7:8
2思茅松AFLP分子标记体系的建立显示文摘采用改进的SDS法,提取思茅松胚乳DNA,获得较高质量的DNA样品,用Eco RI和Pst I 2种限制性内切酶完全酶切后,再经过预扩和选扩,从82对引物中筛选出24对带型分布均匀、多态性高且分辨力强的引物。扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳后,可获得清晰指纹图谱,重复性较好。建立的思茅松AFLP体系可用于后续研究。姚鹏强 李培 王曙光 普晓兰 2012西南林业大学学报(自然科学)2012,32,6:6
3芒AFLP反应体系的建立显示文摘以芒DNA为材料,对AFLP分子标记分析中的基因组酶切体系选择性扩增中Mg2+、dNTP和Taq酶浓度等4个因素进行了比较。结果表明20μL基因组双酶切体系中,使用1UEcoRⅠ和1UM seⅠ酶切3 h能够实现完全酶切;选择性扩增的PCR 10μL反应体系中1.4 mmol.L-1Mg2+,0.4 mmol.L-1dNTP及0.6 U Taq酶是进行芒AFLP分析的最佳反应条件,能够得到丰富稳定的带纹。该体系的构建为AFLP技术在芒相关研究中的应用奠定了基础。胡小虎 刁英 郑兴飞 胡晖 余作平 胡中立 2010氨基酸和生物资源2010,32,3:5
4克氏原螯虾AFLP反应体系的建立显示文摘以克氏原螯虾DNA为材料,对AFLP分析中的基因组酶切时间、选择性扩增中预扩增产物稀释倍数、Mg2+浓度等3个因素进行了比较。结果表明,基因组用EcoRⅠ和MseⅠ双酶切5 h,选择性扩增的PCR反应体系中Mg2+1.5 mmol/L是进行克氏原螯虾AFLP分析的最佳反应条件,能够得到丰富稳定的带纹。而预扩增产物稀释倍数对选择性扩增没有明显影响。该体系的构建为AFLP技术在克氏原螯虾相关研究中的应用奠定了基础。杨帆 姚琪 刁英 郑兴飞 胡中立 舒新亚 2009湖北农业科学2009,48,11:3
5单链DNA纯化对变性PAGE凝胶银染片段回收效率的提高显示文摘为了提高变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)银染后片段回收的效率,本实验在传统的煮沸法的基础上加入单链DNA纯化的步骤对水稻基因组CCGG为点甲基化敏感限制性酶切多态性(MSAP)分析片段进行回收,并对加入该步骤后的再扩增的效率与传统煮沸法进行了比较。实验结果显示,加入单链DNA纯化步骤后的回收效率比传统煮沸法提高了约6倍。改进后的方法可以有效地用于扩增片段长度多态性(AFLP)以及MSAP等差异显示PAGE凝胶银染DNA片段的回收。史金铭 孙野青 2009生物学杂志2009,26,5:3
63个花鳗鲡地理种群的AFLP分析显示文摘应用AFLP分子标记技术首次对澳大利亚、海南岛和菲律宾3个种群的共60尾花鳗鲡(Anguilla marmorata)幼鱼样品进行了遗传多样性分析。4对选择性扩增引物共扩增得到180个位点,平均每对引物扩增出45个位点。澳大利亚、海南岛和菲律宾3个种群的多态位点分别为78.33%、79.44%和84.44%,Nei′s遗传多样性指数分别为0.330 2±0.188 9、0.337 2±0.194 6和0.357 1±0.176 7,Shannon′s多样性指数分别为0.477 3±0.264 7、0.484 4±0.270 2和0.514 6±0.243 3;根据基因分化系数和AMOVA分析估算,3个花鳗鲡种群遗传变异分别有89.25%和96.07%存在于种群内,10.75%和3.93%存在于种群间。基因分化系数、AMOVA分析、遗传距离、基因流、系统树和显性基因型频率分析结果表明:3个花鳗鲡种群间出现了遗传分化,地理距离越大遗传分化程度越高,三者之间出现一定的基因交流。研究结果对花鳗鲡养殖具有指导意义。朱友芳 林凤钦 王艺磊 谢芳靖 2011海洋科学2011,35,8:2
7中国对虾SRAP分子标记体系正交优化及在遗传多样性分析中的应用显示文摘利用正交设计L16(45)对影响中国对虾SRAP分子标记分析的5个因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTP和引物浓度)在4个水平上进行了优化,筛选出各反应因素的最佳水平为:20μl反应体系中包含1.0UTaq酶,2.0mmol/L的Mg2+,40.0ng的模板DNA,0.125mmol/L的dNTP以及0.4μmol/L的引物,退火温度为53.5℃。研究表明,各因素的不同水平对扩增结果有显著影响,其中Mg2+影响最大,影响大小顺序依次为Mg2+,Taq酶,引物,dNTP和模板DNA。利用优化的SRAP分子标记体系对中国对虾'黄海1号'第12世代选育群体进行了遗传多样性分析,实验结果表明,此标记技术可作为中国对虾遗传分析的良好技术工具。遗传多样性分析共筛选出8对可以扩增出清晰稳定条带的引物组合,共获得171个位点,其中多态性位点154个,占90.08%;有效等位基因数为1.7741,期望杂合度均值为0.4219,Shannon多样性指数为0.6055。上述参数值均高于应用AFLP技术对前几代选育群体的遗传多样性分析结果。陈华增 李健 何玉英 李吉涛 王清印 2010渔业科学进展2010,31,6:2
8基于AFLP的垂乳银杏种质遗传多样性分析显示文摘采用AFLP分子标记技术对14份垂乳银杏种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明,8对引物在14份垂乳银杏种质扩增后检测出935条谱带,有920条多态带,多态带比例为98.40%,表明所试垂乳银杏材料具有丰富的多样性;遗传相似系数为0.4404~0.7299,平均值为0.4752,说明各种质之间有一定的遗传分化;聚类分析和主坐标分析将垂乳银杏分成5类,来源相同的种质并没有严格的聚在一起,表明垂乳银杏的变异与地理来源无严格的相关性。吴岐奎 邢世岩 范圣明 王萱 孙立民 刘晓静 2014西南林业大学学报(自然科学)2014,34,3:2
9基于AFLP技术的海南三亚野生和养殖牡蛎遗传多样性研究显示文摘2008年夏季,从海南三亚分别采集26份养殖牡蛎和32份野生牡蛎样品(1份样品代表1个体),开展扩增片断长度多态性(AFLP)和数量性状分析,采用POPGENE 32软件计算多态性位点百分率、遗传多样性指数、Hardy-Weinberg遗传偏离指数、群体遗传相似度和遗传距离。基于AFLP分析获得的遗传距离和线粒体细胞色素氧化酶I亚基(CO I)基因序列,采用邻接法构建养殖和野生牡蛎的系统发育树。结果表明,选择性引物对牡蛎品种具有较好的鉴别效率;相比养殖牡蛎,野生牡蛎多样性丰富、品种间同源性较低、亲缘关系相差较远、遗传基础较宽;通过CO I基因序列分析可知,养殖牡蛎均为香港巨牡蛎Crassostrea hongkongensis,而野生牡蛎属于囊牡蛎属Saccostrea,主要为僧帽牡蛎Saccostrea cucullata。目前海南三亚牡蛎种质资源多样性相对丰富,引种还未对三亚自然环境的牡蛎资源造成明显影响。高晓辉 王春生 吴月红 寿鹿 陈全震 2012海洋学研究2012,30,1:1
10AFLP及其在药用植物中的应用显示文摘文章阐述了AFLP技术的基本原理、特点、发展及其在中药指纹图谱构建、种质或品种鉴定、遗传多样性研究、亲缘关系研究、道地性研究等方面的应用。黄佩蓓 彭海琳 邱咏蔚 2010江西中医学院学报2010,22,3:0
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