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1马铃薯晚疫病抗性相关基因StDIR1的克隆与表达显示文摘马铃薯是世界性粮蔬作物。致病疫霉引起的晚疫病则是马铃薯育种所面临的最严峻问题之一,因此,分离和利用马铃薯晚疫病抗性基因获得抗病新品种是马铃薯育种的重要目标。首先在连翘中发现的一类与木质素合成相关的Dirigent基因可能在植物抗病虫害过程中起重要作用。试验根据马铃薯的EST序列信息设计特异性引物,并通过RT-PCR和RACE技术获得了一条全长为729 bp的Dirigent基因cDNA序列,命名为StDIR1;该cDNA编码一个包含191个氨基酸的蛋白质多肽;系统进化分析表明,该多肽是一种Dirigent-like蛋白,属于DIR-b亚群,与陆地棉Di-rigent-like protein 1相似性高达76%,同一性为62%。利用半定量RT-PCR技术分析发现,致病疫霉、H2O2以及NO可以诱导该基因不同程度的上调表达。组织特异性分析表明,该基因在马铃薯根组织中表达量最高,而在茎、叶、花以及块茎组织中的表达量偏低。首次表明StDIR1基因与马铃薯对致病疫霉的侵染应答具有相关性。张洪伟 李继刚 郑建坡 曲占良 2012华北农学报2012,27,2:5
2烟草蛋白酶抑制剂基因的电子克隆及生物信息学分析显示文摘蛋白酶抑制剂可以增强植物对病虫害的抵抗能力,为了深入研究蛋白酶抑制剂在烟草中的作用机制,利用生物信息学的方法,成功获得了烟草品种K326中的4种蛋白酶抑制剂cDNA序列(NtPI-1、NtPI-2、NtPI-3和NtPI-4)并对其进行了序列分析。它们编码的氨基酸序列都具有典型的马铃薯蛋白酶抑制剂Ⅰ家族功能结构域,属于马铃薯蛋白酶抑制剂Ⅰ家族成员。序列分析表明,4种蛋白酶抑制剂基因cDNA序列均具有完整的开放读码框,依次编码128、95、94和72个氨基酸残基,它们的氨基酸序列一致性在31%-38%之间。系统树分析表明,烟草品种K326中的4种蛋白酶抑制剂分散在进化树的不同位置,形成不同亚群。林世锋 王仁刚 任学良 2012生物技术通报2012,28,4:4
3番茄蛋白酶抑制剂基因SLPI100的克隆、表达与生物信息学分析显示文摘蛋白酶抑制剂(protease inhibitor,PI)在植物系统防御中发挥着关键作用。为研究番茄PI基因的表达模式及其编码蛋白的相关性质,本研究从番茄(Solanum lycopersicum)中克隆了一个PI基因家族的成员,命名为SLPI100(登录号:XP_004249682.1)。该基因编码区长为285 bp,编码94个氨基酸、蛋白的半衰期30 h、不稳定指数37.5、脂肪族指数121.17、平均疏水性0.189、理论等电点9.38、相对分子量10.52 kD、为疏水性蛋白。经同源性分析和多序列比对得知该基因具有PI功能结构域,属于马铃薯蛋白酶抑制剂I家族。qRT-PCR分析显示SLPI100在番茄根中的表达量最高,其次为叶,推测其在抗土传病害和叶部病害过程中发挥重要功能;在致病疫霉菌(Phytophthora infestans)的侵染下,该基因的相对表达量呈现先升高后下降的趋势,表明其在番茄与病原菌互作过程中发挥重要作用。本研究为番茄PI基因功能的鉴定以及培育抗病工程植株奠定了基础。马宁 刘亚荣 崔军 洪雨慧 栾雨时 2020基因组学与应用生物学2020,39,10:1
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