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1DNA自组装的可满足性问题模型显示文摘DNA自组装技术在DNA计算和纳米技术领域都发挥着极其重要的作用,许多小规模NP完全问题都可以通过自组装模型得以解决.文中以可满足问题为模型,通过构造范式中变量的特殊补链,使其与初始数据库中初始DNA链发生杂交反应,形成发夹结构,利用形成发夹结构的DNA链与没形成发夹结构的DNA链长度不同的特点,通过凝胶电泳将这些带发夹的DNA链提取出来;然后加入与这些特殊补链完全互补的DNA链,在一定温度下,通过碱基互补配对原则,发夹结构又将被重新打开.该模型充分利用了DNA分子间的自组装能力,在计算过程中只需要用到凝胶电泳操作,在一定程度上大大减少了因生物操作过多而引起的各种实验误差.宋勃升 殷志祥 甄诚 华程 2011小型微型计算机系统2011,32,9:9
2有向图k边导出子图的DNA粘贴算法显示文摘针对经典计算的有向图k边导出子图生成算法时间复杂度较高问题,提出了一种在脱氧核糖核酸粘贴机上运行的子图生成算法.首先,以粘贴系统提供的标准生化元操作为算法使用的基本元算子,并使用元操作所产生的生化结果的图论解释作为元算子的最小语义单元;其次,使用包括顺序、循环等在内的程序控制结构,设计一定的逻辑方式把元算子组织起来,以计算有向图导出子图.复杂度分析表明,新算法可在线性时间生成所有子图.仿真实验结果表明,与经典算法相比,新算法在理想条件下大幅降低了子图生成时间.朱维军 徐朝辉 张海宾 杨卫东 2013西安电子科技大学学报2013,40,5:1
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