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1东乡野生稻抗褐飞虱QTL分析显示文摘野生稻是水稻抗褐飞虱基因的重要种质资源。应用东乡野生稻与栽培稻协青早B构建的2套材料,开展水稻抗褐飞虱基因鉴定研究。先以协青早B//协青早B/东乡野生稻BC1F5群体为材料,应用褐飞虱田间种群进行抗虫鉴定,检测到2个抗褐飞虱QTL,其中,qBph2位于水稻第2染色体RM29-RG157区间,东乡野生稻等位基因可降低死苗率22.2%;qBph7位于第7染色体RM11-RM234区间,东乡野生稻等位基因可降低死苗率43.7%。进一步以协青早B为轮回亲本,构建了BC3F3群体,应用褐飞虱生物型I、II和III进行抗虫鉴定,QTL分析表明qBph2抗褐飞虱生物型I和II,qBph7抗褐飞虱生物型I和III。这2个QTL对培育抗褐飞虱水稻品种具有重要应用价值。黄得润 陈洁 赖凤香 刘光杰 庄杰云 2012作物学报2012,38,2:12
2协青早B//协青早B/东乡野生稻BC1F5群体产量性状QTL分析显示文摘同地2年种植种间杂交组合协青早B(Oryzasativa)//协青早B/东乡野生稻(O.rufipogon)的202个BC1F5株系,利用含149个DNA标记的连锁图谱,检测到23个产量性状QTLs,包括每株穗数2个、每穗实粒数4个、每穗总粒数6个、结实率5个、千粒重4个和单株产量2个;有9个QTLs的增效等位基因来自东乡野生稻,包括每株穗数2个、每穗实粒数1个、每穗总粒数5个和千粒重1个,其中6个与前人应用野栽群体检测到的产量性状QTLs位于相似区间。这23个QTLs分布除第11染色体外的所有水稻染色体中,其中18个形成8个QTL簇,含增效等位基因来自野生稻的2个、来自协青早B的4个,效应方向发生变化的2个。黄得润 陈洁 侯丽娟 樊叶杨 庄杰云 2008农业生物技术学报2008,16,6:9
3稻属植物的基因组进化显示文摘水稻所在的稻属(Oryza)共有24个左右的物种。由于野生稻含有大量的优良农艺性状基因,在水稻遗传学研究中日益受到重视。随着国际稻属基因组计划的开展,越来越多的稻属基因组序列被测定,稻属成为进行比较、功能和进化基因组学研究的模式系统。近期开展的一系列研究对稻属不同基因组区段以及全基因组序列的比较分析,揭示了稻属在基因组大小、基因移动、多倍体进化、常染色质到异染色质的转化以及着丝粒区域的进化等方面的分子机制。转座子的活性以及转座子因非均等重组或非法重组而造成的删除,对稻属基因组的扩增和收缩具有重要作用。DNA双链断裂修复介导的基因移动,特别是非同源末端连接,是稻属基因组非共线性基因形成的主要来源。稻属基因组从常染色质到异染色质的转换过程,伴随着转座子的大量扩增、基因片段的区段性和串联重复以及从基因组其他位置不断捕获异染色质基因。对稻属不同物种间基因拷贝数、特异基因和重要农艺性状基因的进化等研究,可揭示稻属不同物种间表型和适应性差异的分子基础,将加速水稻的育种和改良。刘铁燕 陈明生 2014生物多样性2014,22,1:5
4Linkage map construction and QTL mapping for cold tolerance in Oryza rufipogon Griff. at early seedling stage显示文摘Cold stress is one of the major restraints for rice production. Cold tolerance is controlled by complex genetic factor. In this study, a backcross inbred lines(BILs) population derived from an inter-specific cross(Oryza sativa L.×O. rufipogon Griff.) was used for genetic linkage map construction and quantitative trait locus(QTL) mapping. A linkage map consisting of 153 markers was constructed, spanning 1 596.8 c M with an average distance of 11.32 c M between the adjacent markers. Phenotypic evaluation of the parents and BILs under(6±1)°C cold stress revealed that the ability of cold tolerance in BILs at early seedling obeyed a skewed normal and continuous distribution. Fifteen QTLs on chromosomes 6, 7, 8, 11, and 12 were identified using sur vival percent(SP) and non death percent(NDP) as ind icators of cold tolerance, which could explain 5.99 to 40.07% of the phenotypic variance, of which the LOD values ranged from 3.04 to 11.32. Four QTLs on chromosomes 3, 5 and 7 were detected using lea f conductivity(LC) and root conductivity(RC) as indicators of cold tolerance, ranging from 19.54 to 33.53% for the phenotypic variance explained and 2.54 to 6.12 for the LOD values. These results suggested that there might be multi major QTLs in O. rufipogon and some useful genes for cold tolerance have been transferred into cultivated rice, which would be helpful for cloning and utilizing the cold tolerance-responsive genes from wild rice.LUO Xiang-dong ZHAO Jun DAI Liang-fang ZHANG Fan-tao ZHOU Yi WAN Yong XIE Jian-kun 2016Journal of Integrative Agriculture2016,15,12:3
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