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| 1 | 长江草鱼不同群体EST-SSR多态性标记的筛选及其遗传结构分析显示文摘为对我国不同地域草鱼群体进行鉴定和遗传多样性分析,在2400条草鱼EST序列中,对其二碱基至五碱基重复序列进行筛选,共筛选出微卫星位点181个,选取其中的46个进行引物的设计与合成,获得呈多态性的微卫星引物9对。利用这9对引物对8个长江水系草鱼群体和1个红色草鱼自然突变群体进行了遗传结构分析。结果显示,长沙草鱼、安庆草鱼、嘉兴草鱼、靖江草鱼、石首草鱼、松江草鱼、瑞昌草鱼、邗江草鱼和红色突变草鱼9个群体的平均等位基因数(Na)分别为4.67、5.22、5.33、5.00、4.89、4.78、4.89、4.67和2.56,平均期望杂合度(He)分别为0.6397、0.6543、0.6831、06356、0.6737、0.6483、0.6664、0.7129和0.4696,平均多态信息含量(PIC)分别为0.5787、0.6126、0.6283、0.5894、0.6217、0.5956、0.6136、0.6582和0.3949,表明邗江草鱼的遗传多样性最高,而红草鱼的遗传多样性最低。聚类分析表明,8个长江水系草鱼群体首先聚类,最后与红色草鱼聚类;其中,安庆草鱼与松江草鱼首先聚为一支,遗传距离较近,为0.0725;红色草鱼与长沙草鱼的遗传距离最远,为0.5217。研究结果对我国草鱼种质资源保存、种群鉴定和良种选育具有重要意义。 | 郑国栋 陈杰 蒋霞云 邹曙明 | 2015 | 水生生物学报2015，39，5： | 19 |
| 2 | 鲤鱼三、四核苷酸重复微卫星座位的筛选及特征分析显示文摘采用磁珠富集法结合放射性同位素杂交法分离出鲤鱼(Cyprinus carpio)三、四核苷酸重复的微卫星阳性克隆1248个。对其中的384个克隆进行测序分析,共得到微卫星序列325个,其中完美型244个(75.08%),非完美型59个(18.15%),混合型22个(6.77%)。依据得到的微卫星序列,用Primer 3软件在线设计并合成引物145对,检测结果显示71.43%(80对/112对)的引物在野生个体间表现出多态性,等位基因数在3~12之间,多态信息含量(PIC)在0.2109~0.8607之间,80%(40对/50对)的位点处于高度多态水平(PIC〉0.5)。对群体的遗传结构评估结果显示,四核苷酸重复的微卫星标记在黑龙江鲤野生群体表现出的多态性水平(PIC=0.7740)高于三核苷酸重复(PIC=0.5161)和双核苷酸重复(PIC=0.49),适用于群体间遗传差异分析和遗传连锁图谱的构建。 | 鲁翠云 毛瑞鑫 李鸥 耿龙武 孙效文 梁利群 | 2009 | 农业生物技术学报2009，17，6： | 16 |
| 3 | 用鲤鱼EST-SSRs分子标记分析长江黑龙江鲤种群结构显示文摘从鲤鱼(Cyprinus carpio)ESTs的数据库(10691个)中进行微卫星序列筛选,共发现微卫星序列127个,占整个ESTs数据库的1.19%;另外从本研究室构建的鲤鱼脑组织cDNA文库中筛选到微卫星序列20个。根据筛选得到的微卫星序列设计引物68对,合成引物40对,其中27对引物能够获得预期的目的片段,20对引物在所检测的群体内及群体间表现出多态性。用此20对引物标记的多态性分析了长江鲤(Cyprinus carpio)和黑龙江鲤(C.carpio var haematopaerus.Temminck et Schlegel)的群体遗传结构,结果表明:长江鲤和黑龙江鲤在多数位点表现出较高的遗传多样性,20个位点的平均有效等位基因数分别为3.9135和3.4820;平均观察杂合度为0.6067和0.5667;平均期望杂合度为0.6737和0.6194;平均多态信息含量为0.6308和0.5714。长江鲤的遗传结构好于黑龙江鲤,两个群体的Hardy-Weinberg偏离指数较小,群体基本保持平衡,群体结构较合理;其中HLJE1和HLJE10位点在长江鲤和黑龙江鲤的扩增结果相差较大,长江鲤的多态性明显高于黑龙江鲤,位点多态信息含量相差1倍以上,可用于群体的鉴别。 | 鲁翠云 全迎春 李大宇 孙效文 梁利群 | 2007 | 农业生物技术学报2007，15，6： | 15 |
| 4 | EST-SSR分子标记在水生动物遗传研究中的应用显示文摘 | 张琼 刘小林 李喜莲 薛姝雯 辛静静 黄皓 相建海 | 2010 | 水产科学2010，29，5： | 11 |
| 5 | 马氏珠母贝F8代4种壳色选育群体的EST-SSR遗传多样性分析显示文摘利用10对EST-SSR分子标记研究红、白、黑、黄4种壳色马氏珠母贝F8代人工选育群体的遗传多样性。结果显示,10个位点共扩增出46个等位基因,各位点的等位基因数为2~7。红、黑、白、黄4种壳色群体的平均等位基因数分别为4.0、3.7、3.6、3.5;平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.445~0.627和0.479~0.580;Shannon多样性指数为0.850~1.042;平均多态信息含量为0.423~0.509。黄壳色群体中各遗传参数值最小,而红壳色群体中除有效等位基因数外,其余参数(等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量、Shannon多样性指数)值均最大。40个群体—位点组合中有31个组合显著偏离平衡(P<0.05),占总位点的77.5%。群体间的遗传分化指数为0.0101~0.3025,平均值为0.1206(0.05<遗传分化指数<0.15),处于中等程度分化,这与课题组8年定向选育有关。群体间的基因流值为0.5764~24.5841,平均值为1.8225。红壳色群体和黑壳色群体的遗传相似系数最大(0.8418),遗传距离最小(0.1722),最先聚为一类;白壳色群体和黄壳色群体的遗传相似系数最小(0.7107),遗传距离最大(0.3415)。经8代群体继代选育,4种壳色马氏珠母贝群体仍保持着较高的遗传多样性,其中红壳色群体的遗传多样性最高,黄壳色群体的遗传多样性最低。 | 谭杰 孙宗红 陶雅晋 姚高友 刘付少梅 刘锦上 刘志刚 | 2018 | 水产科学2018，37，4： | 4 |
| 6 | 凡纳滨对虾EST-SSR标记的筛选及遗传多态性检测显示文摘为了研究我国海南地区某凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)繁育群体的种质资源多样性,选取14个比利时野生对虾的EST微卫星标记,以240个中国人工选育的凡纳滨对虾个体为研究对象,检测这些标记在该养殖群体遗传多样性评估中的可行性,结果表明,有7个引物可扩增出清晰条带,其中5个引物(CNM-MG 345,CNM-MG 390,CNM-MG 437,CNM-MG 444,CNM-MG 487)具有多态性,共获得12个等位基因,平均等位基因数为2.400 0±0.547 7,平均有效等位基因数为2.060 0±0.327 8,平均观察杂合度为0.533 3±0.233 1,平均期望杂合度为0.505 2±0.082 6,平均多态信息含量为0.4090±0.0862,表明筛选出来的5个EST微卫星标记可以用于海南地区凡纳滨对虾人工繁育品种的遗传多样性分析,研究群体的多态性差异比较显著,遗传多样性处于中度水平。对我国凡纳滨对虾养殖群体和比利时凡纳滨对虾野生群体的遗传差异性进行了探究。两个群体的遗传变异可能受到地理隔离及多代定向选育的影响。研究结果为凡纳滨对虾EST微卫星遗传多样性研究、对虾人工选育及种质利用提供了可靠的科学依据。 | 张琼 李喜莲 薛淑雯 刘小林 黄皓 相建海 | 2011 | 海洋学报2011，33，1： | 3 |
| 7 | Analysis of New Microsatellite Markers Developed From Reported Sequences of Japanese Flounder Paralichthys olivaceus显示文摘The expressed sequence tags (ESTs) of Japanese flounder, Paralichthys olivaceus, were selected from GenBank to iden-tify simple sequence repeats (SSRs) or microsatellites.A bioinformatic analysis of 11111 ESTs identified 751 SSR-containing ESTs, including 440 dinucleotide, 254 trinucleotide, 53 tetranucleotide, 95 pentanucleotide and 40 hexanucleotide microsatellites respec-tively.The CA/TG and GA/TC repeats were the most abundant microsatellites.AT-rich types were predominant among trinucleotide and tetranucleotide microsatellites.PCR primers were designed to amplify 10 identified microsatellites loci.The PCR results from eight pairs of primers showed polymorphisms in wild populations.In 30 wild individuals, the mean observed and expected het-erozygosities of these 8 polymorphic SSRs were 0.71 and 0.83 respectively and the average PIC value was 0.8.These microsatellite markers should prove to be a useful addition to the microsatellite markers that are now available for this species. | YU Haiyang JIANG Liming CHEN Wei WANG Xubo WANG Zhigang ZHANG Quanqi | 2010 | Journal of Ocean University of China2010，9，4： | 2 |
| 8 | 马氏珠母贝F8代黑壳色选育系群体与普通养殖群体遗传多样性分析显示文摘利用9个SSR分子标记研究马氏珠母贝F8代黑壳色选育群体与普通养殖群体的遗传多样性。结果显示:9个位点共检测出30个等位基因,各位点的等位基因数(Na)为2~5,平均等位基因数为3.3333个。F8代黑壳色选育系群体和普通养殖群体的平均等位基因数(Na)分别为2.7778、3.2222;平均有效等位基因数(Ne)分别为2.1625、2.0319;平均多态信息含量PIC值范围为0.1291~0.7300,平均期望杂合度(He)范围为0.2231~0.8577,平均观测杂合度(Ho)范围为0~0.9500。F8代黑壳色选育系群体有3个位点观测杂合度为0,说明这3个位点已被纯化。哈迪-温伯格平衡(HWE)检验发现,F8代黑壳色选育系群体中有7个位点、普通养殖群体中有5个位点极显著偏离平衡(p<0.01)。两群体遗传分化系数(Fst)为0.1463。各项遗传参数表明,经8代群体继代选育,马氏珠母贝黑壳色选育系群体部分位点已被纯化,遗传多样性较普通养殖群体有所降低,但仍保持在较高水平。 | 李镒民 丁琳琳 谭杰 苏晓盈 刘志刚 刘付少梅 | 2019 | 基因组学与应用生物学2019，38，11： | 1 |
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