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1蛋白质乙酰化修饰研究进展显示文摘蛋白质乙酰化是一种普遍存在的、可逆而且高度调控的蛋白质翻译后修饰方式,主要发生在蛋白质赖氨酸残基的ε-NH2位。乙酰化的研究历史已达50多年,目前已成为国际上蛋白质领域的研究热点。乙酰化修饰由乙酰基转移酶和去乙酰化酶共同调节,且参与了几乎所有的生物学过程,如转录、应激反应、新陈代谢以及蛋白合成与降解等。近年来,乙酰化修饰的检测技术发展迅速,从已广泛应用的质谱法到新技术如蛋白质芯片的加入,都为深入研究乙酰化提供了强有力的工具。蛋白质乙酰化应用广泛,主要在代谢疾病中发挥着重要的调控作用,而且去乙酰化酶抑制剂已经成为治疗心脏病、糖尿病和癌症等多种疾病的有潜力的试剂。围绕乙酰化的研究历程、功能、检测技术和应用进行了探讨和归纳,并在此基础上进行了展望和讨论。吕斌娜 梁文星 2015生物技术通报2015,31,4:9
2关键酶泛素化位点对柚皮素生物合成的影响显示文摘黄酮类化合物具有多种生物活性,在食品、药品、化妆品等领域都有重要应用。柚皮素是多种重要黄酮类化合物生物合成的平台化合物。泛素化是蛋白质翻译后修饰的重要一环,参与调控细胞的生命活动。泛素化的蛋白质通过泛素-蛋白酶体系统降解,对维持细胞正常生理活动具有重要意义,对外源蛋白的表达和积累也可能具有显著影响。文中利用荧光双分子互补法在酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae中建立了泛素化修饰的实时原位检测体系,以荧光强度表征蛋白的泛素化修饰程度。应用该方法获得了柚皮素合成途径中5个关键酶的潜在泛素化位点。将相关泛素化位点的赖氨酸突变为精氨酸,用于降低关键酶的泛素化修饰程度。其中,酪氨酸解氨酶FjTAL、查尔酮合成酶SjCHS、SmCHS突变体表现为荧光下降,表明其泛素化水平有所降低。发酵结果表明,表达酪氨酸解氨酶FjTAL突变体FjTAL-K487R的酿酒酵母在发酵72 h后获得了74.2 mg/L的对香豆酸产量,相较于原始FjTAL提高了32.3%,而表达查尔酮合成酶突变体的酿酒酵母产量没有明显变化。结果表明,对柚皮素生物合成途径相关蛋白的潜在泛素化位点进行突变,能够提高对香豆酸产量,对柚皮素生物合成有积极影响。李明佳 周景文 李江华 2022生物工程学报2022,38,2:2
3ASFV pp62 Protein Has 9 Dominant B-T Cell Combined Epitopes显示文摘[Objective]The paper was to study the basic characteristics of the pp62 protein of the African swine fever virus strain Pig/HLJ/2018,and to provide more basic data for the study of the virus.[Method]We used the ProtParam program to analyze the physical and chemical properties of the pp62 protein.TMHMM-2.0 and SignalP-5.0 were used to analyze protein transmembrane region and signal peptide,and Lasergene 7.0 Protean program was used to study protein antigen index,hydrophilicity,surface accessibility and titration curve.Protein N-glycosylation site and O-glycosylation site came out with NetNGlyc-1.0 and NetOGlyc-4.0 online servers.Then,PSIPRED-4.0,NetSurfP-2.0,and PSRSM were used to analyze protein secondary structure,BepiPred1.0 and IEDB tools were used to analyze protein B-cell epitopes,and NetMHC 4.0 and NetMHCpan tools were used to analyze protein T-cell epitopes.And we used Swiss-Model to analyze the high-level structure of the protein,the EzMol tool to visually analyze B-T cell combined epitopes,and finally,MEGA 7.0 to analyze the genetic evolutionary relationship of the protein.[Result]The pp62 protein of African swine fever viral strain Pig/HLJ/2018 had a molecular weight of 60.5 kDa.It was a hydrophilic acid labile protein,and had no transmembrane region and signal peptide.There were 5 N-glycosylation sites and 4 O-glycosylation sites.Analysis of the secondary structure of the protein showed that the proportions of helix,coil and strands were 45.5%,41.7%and 12.8%,respectively.The study of dominant epitopes revealed that there were 14 dominant B-cell epitopes and 16 dominant T-cell epitopes.And 9 dominant B-T cell combined epitopes located on the surface of the protein molecule were found.The phylogenetic tree constructed with the pp62 protein showed that the evolutionary relationship of Pig/HLJ/2018 strain was the closest to Georgia/2007/1,which belonged to genotype II.[Conclusion]The results will provide basic information for pp62 research.Cao Qianda Dai Bihong Yang Yang Cao Xuelian 2022Animal Husbandry and Feed Science2022,14,4:1
4对应关系形成的一般分子机制显示文摘对应关系形成的分子机制的阐明对于在理论上深入了解对应关系本质和生命系统运行机制,在应用方面帮助人工利用、干预或构建对应关系具有重要意义.分子生物学的快速发展为对应关系的分子机制进行更深入和全面的认识提供了条件.本文在综合比较各种生物大分子基础上,提出系统性的多单体生物大分子模型理论,试图揭示对应关系形成的一般分子机制.该模型理论认为多单体生物大分子具有种类的高多样性,对应关系对多单体生物大分子高效完成各种生物学功能具有必要性,同时,多单体生物大分子的结构和性质也为对应关系的形成提供了可能性.对应关系的形成过程是一个相对独立的可分为3个阶段的复杂过程.在多单体生物大分子结构和性质基础上,从与配体间的识别机制、作用机制及亲和性三方面揭示了对应关系的形成机制.对多单体生物大分子产生对应关系的必然性、形成的分子机制的复杂性及在理论和应用方面的重要价值也进行了讨论.孙世中 官会林 陈金莲 2015中国生物化学与分子生物学报2015,31,2:0
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