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1霍乱弧菌JS9803株CTX^(EI Tor)φ和nct-CTX^(newO139)φ基因组克隆、测序及序列分析显示文摘目的霍乱弧菌JS9803株CTXEITorφ和nct-CTXnewO139φ基因组克隆、测序及序列分析。方法基因亚克隆、测序及序列生物信息学分析。结果霍乱弧菌9803株CTXEITorφ基因组与EITor类型的高度同源,RS区为双拷贝,核心区为单拷贝,RS侧和核心区侧染色体部分序列分别为TLC和RTX基因簇。nct-CTXnewO139φ基因组与已报道的其它类型比较,rstR基因及推测的氨基酸序列同源性分别为27.6%~50.5%和14.1%~48.4%,间隔区ig-2基因同源性25.2%~29.6%,表明rstR-ig2为新类型,该基因组附近染色体部分序列也为新发现的基因。结论在霍乱弧菌中发现新类型rstR-ig2的nct-CTXnewO139φ基因组,并和CTXEITorφ基因组共存。芮勇宇 阚飙 高守一 刘延清 祁国明 2006热带医学杂志2006,6,8:3
2霍乱弧菌抑制子基因及间隔区(rstR-ig2)多态性研究显示文摘目的研究霍乱弧菌CTXφ基因组抑制子基因及间隔区(rstR-ig2)多态性。方法聚合酶链反应(PCR)及限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)、型特异性引物PCR分型。结果霍乱弧菌(VC)O1群古典型(CVC)5株均为class类型。VCO1群埃尔托型(EVC)155株共分为4个类型:class、ET、class+ET、class+newET,后2个类型为首次发现。不同地区分离的EVC均以ET类型为主,以class和class+ET类型为辅。O139群VC82株共分为4个类型:ET、ET+newO139、ET+calc、ET+calc+newO139,后3个类型为首次发现;福建省分离的菌株以ET+newO139类型为主,其它地区分离的均以ET类型为主。结论EVC和O139群VC的rstR-ig2基因均以ET类型为主,首次发现5种不同类型rstR-ig2基因共存的新类型。芮勇宇 阚飙 高守一 王前 裘宇容 2007热带医学杂志2007,7,2:1
3非产毒霍乱弧菌基因组流行病学研究进展显示文摘非产毒霍乱弧菌指缺乏主要毒力基因ctxAB而不能产生霍乱毒素的霍乱弧菌。部分非产毒霍乱弧菌可以定植人类肠道,引起腹泻等疾病,但由于临床症状相对较轻而容易被忽视。基因组流行病学基于群体基因组学研究方法,结合传统流行病学调查结果,可以对食品和临床来源的非产毒霍乱弧菌进行溯源及传播分析。该学科的发展极大促进了对非产毒霍乱弧菌遗传多样性、致病机制及传播规律的认识。研究表明部分非产毒霍乱弧菌谱系,如L3b和L9谱系已在全球多个国家流行,对食品质量安全形成风险。本文从基因组特征、遗传分型、重要遗传因子及国内外传播规律4个方面,归纳总结了非产毒霍乱弧菌基因组流行病学相关研究进展,以期为非产毒霍乱弧菌的检测、监测及其相关食源性疾病防控工作提供参考。郝彤宇 秦婧靓 武雅蓉 崔玉军 2021食品安全质量检测学报2021,12,17:1
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