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1溃疡性结肠炎脾胃虚实证候核糖体蛋白基因表达研究显示文摘目的研究健康人、溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)脾虚证和湿热证患者核糖体蛋白(ribo-somal protein,RP)基因表达差异情况,为从蛋白合成角度理解'脾为气血生化之源'提供实验依据。方法制作RP基因芯片,对4名健康人、4例UC脾虚证和4例UC湿热证患者结肠黏膜进行检测,应用BRB-TOOL(3.9)软件包进行数据分析,对差异基因进行生物信息学分析。结果成功制作了包括77条RP基因,2条RP类似基因(RPL26-like1、RPL7-like1)的低密度芯片。UC(脾虚证+湿热证)患者与健康人之间有12条差异基因,全部为下调基因;湿热证与健康人之间有19条差异基因,全部呈下调趋势;脾虚证与健康人有3条差异表达基因,全部为下调基因;脾虚证与湿热证有6条差异表达基因,全部为上调基因。聚类分析显示健康人与UC患者样品可以根据本芯片的基因表达谱进行分类,湿热证和脾虚证可以通过聚类分开。多个差异基因有共同转录调节因子。结论成功制作了RP基因芯片,UC脾虚证和湿热证RP基因表达下调;健康人、UC脾虚证和UC湿热证都有各自相应的RP基因表达谱。陈玉龙 陈蔚文 李茹柳 林传权 高小玲 郭文峰 2011中国中西医结合杂志2011,31,5:1
2肠道巨噬细胞在溃疡性结肠炎中的功能分析显示文摘目的采用单细胞测序分析溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)患者肠道组织中巨噬细胞差异基因及其功能。方法挖掘数据集GSE150115,分析5例UC患者肠黏膜组织10×Genomics单细胞转录组测序数据,采用Seurat软件进行细胞亚群分类、巨噬细胞识别、细胞间差异基因筛选、GO和KEGG生物信息学分析。结果从10个细胞亚群中识别出巨噬细胞,筛选出细胞间差异基因,如CR1、BCL11A等。GO及KEGG分析发现,巨噬细胞的核糖体信号通路可能参与UC疾病过程。结论肠道巨噬细胞可能通过核糖体信号通路影响UC。顾雪香 王宏刚 戴伟杰 吴尚农 马天恒 2022胃肠病学和肝病学杂志2022,31,2:1
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