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| 1 | 转录因子在基因可变剪接中的作用显示文摘转录因子大多在细胞中表达,并参与调控机体内很多重要的细胞生物过程,是生物体内不可或缺的组成成分,其可以通过各种机制和不同程度的特异性调控可变剪接过程,从而促进基因表达。可变剪接与生物体的发育、细胞凋亡及疾病的发生关系密切,而前体mRNA(Pre-mRNA)的可变剪接是生物体转录组及蛋白质组多样性的重要成因,并且可以精准地完成受顺式调控元件、表观信息等综合因素的调控。因此,文章综述了转录因子在基因可变剪接中的作用,以期为细胞凋亡、疾病发生等生物过程的研究提供理论基础。 | 翁雅娟 特日格乐 宋代玲 王国庆 蔺雅楠 芒来 李蓓 | 2023 | 黑龙江畜牧兽医2023，，17： | 0 |
| 2 | 剪接因子hnRNPF对蒙古马精子生成的影响显示文摘旨在探究可变剪接因子核不均一核糖核蛋白F(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F,hnRNPF)对蒙古马精子生成的影响。本研究提取并培养3岁性成熟蒙古马睾丸支持细胞;构建hnRNPF过表达慢病毒载体,将载体转染至蒙古马睾丸支持细胞中;每组3个重复,分别在转染0、24、48、72 h时利用CCK-8检测转染后细胞增殖情况并确定最佳转染时间;提取转染后与未转染的蒙古马睾丸支持细胞RNA,设计已知与精子生成相关基因的引物进行qRT-PCR试验,检测精子生成相关基因在两种细胞中的表达情况。琼脂糖凝胶电泳结果显示,hnRNPF慢病毒过表达载体构建成功;CCK-8检测发现,细胞经过表达慢病毒载体转染72 h后活性最高,并且转染后细胞活性要高于未转染细胞活性,说明hnRNPF过表达会促进蒙古马睾丸支持细胞的增殖;qRT-PCR结果显示,精子生成相关基因(PKMYT1、CDC25C、YWHAZ、BUB1、BTRC、CCNE1、CALM1、PLK1、REC8、MAPK3、ADCY7)在两种细胞中的表达量差异显著,均在转染hnRNPF过表达载体细胞中含量较高。本试验结果表明,剪接因子hnRNPF可能对于蒙古马精子生成具有直接或间接的促进作用,为提高蒙古马精子数量和精液品质提供了新的思路。 | 翁雅娟 李蓓 芒来 薛嘉宁 特日格乐 宋代玲 王国庆 蔺雅楠 | 2024 | 畜牧兽医学报2024，55，2： | 0 |
| 3 | 蒙古马和纯血马免疫相关基因差异表达分析显示文摘为了评价蒙古马(Equus mongolian horse)和纯血马(E.thoroughbred)免疫生理机能在适应特殊生存环境和人工选择压力过程中相关基因的表达多样性。本研究对健康成年蒙古马(n=3)和纯血马(n=3)的颈静脉血液进行RNA-Seq和品种间表达谱比较分析。对2岁左右健康蒙古马(n=3)和纯血马(n=3)采集肝脏、脾脏、肺脏和血液样品,利用qRT-PCR方法,分析NF-κB信号通路7个基因在两个品种中的表达情况。利用Western blot方法,分析蒙古马和纯血马肺脏中核因子κB亚基p65(RELA proto-oncogene NF-kB subunit,NF-κB p65)蛋白和白细胞介素1β(interleukin 1 beta,IL-1β)蛋白的表达情况。结果表明,RNA-Seq共获得19.69~23.95 Gb的高质量数据和1199个差异表达基因,许多差异表达基因直接参与机体的免疫过程。NF-κB信号通路7个基因在蒙古马和纯血马4个免疫组织中均表达,基因表达的品种间差异存在组织多样性;7个基因在蒙古马肺脏的表达量均高于纯血马,除肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF-α)基因差异不显著外(P≥0.05),其余基因均具有生物学统计意义(P<0.05)。NF-κB p65蛋白和IL-1β蛋白在蒙古马肺脏的表达量高于纯血马(P<0.05)。许多免疫相关基因在蒙古马和纯血马免疫组织之间差异表达,可能和蒙古马适应特定环境以及纯血马的运动性能定向选育有关。本研究结果为进一步研究蒙古马免疫功能适应特定环境的分子机制提供数据支持。 | 任秀娟 康德措 苏少锋 蔺雅楠 李雅静 杜明 白东义 李蓓 赵一萍 芒来 | 2023 | 畜牧兽医学报2023，54，12： | 0 |
| 4 | 母马生殖道微生物与疾病的研究进展显示文摘母马的生殖健康对于现代马产业的转型升级和可持续发展具有重要意义。母马生殖系统的微生态平衡可显著增加阴道内的微生物多样性,进而改善机体健康。文章介绍了母马生殖道结构组成、生殖道微生物与阴道/子宫炎症的相关性,论述了性行为或人为干预对生殖道健康的影响及治疗生殖道疾病的方法,以期为改善母马生殖道健康、研发马健康平台和建立疾病预防的手段提供科学依据,也为母马生殖道微生物多样性分析及益生菌的应用研究提供新的视角。 | 陶金山 苏少锋 张建强 吴海青 程超 李雅静 蔺雅楠 王秀美 芒来 赵一萍 | 2023 | 黑龙江畜牧兽医2023，，5： | 0 |
| 5 | 蒙古马母体与胎儿胃肠道NF-κB信号通路相关基因mRNA相对表达水平研究显示文摘[目的]研究蒙古马母体与胎儿胃肠道不同区段NF-κB信号通路相关基因的mRNA相对表达水平。[方法]选取3匹体况良好的妊娠蒙古马进行屠宰,屠宰过程中取出胎儿,分别采集母体及胎儿的胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、大结肠、小结肠和直肠组织;采用实时荧光定量PCR方法(qPCR),对NF-κB信号通路上6个相关基因(NF-κB p50、NF-κB p65、NFKBIA、IL-1β、TNF-α和IL-8)的mRNA相对表达量进行分析,比较母体和胎儿胃肠道不同区段组织中各基因的表达差异。[结果]NF-κB信号通路上6个基因在蒙古马母体和胎儿胃肠道不同区段8个组织中均有表达;总体来看,NF-κB p50、NF-κB p65和NFKBIA基因的mRNA相对表达量在母体和胎儿上均较高,IL-1β、TNF-α和IL-8基因的mRNA相对表达量均较低。在胃肠道区段8个组织中,6个基因的mRNA相对表达量基本呈现母体高于胎儿的特征;在回肠和盲肠组织中,母体NF-κB p50基因的mRNA相对表达量显著(P<0.05)高于胎儿;在大结肠组织中,母体NF-κB p65基因和NFKBIA基因的mRNA相对表达量显著(P<0.05)高于胎儿。[结论]NF-κB信号通路上6个基因在蒙古马母体和胎儿胃肠道8个组织中均有表达,且存在一定差异;母体部分肠道区段组织中的NF-κB p50、NF-κB p65、NFKBIA基因mRNA相对表达量显著高于胎儿。 | 蔺雅楠 赵媛 苏少锋 赵俊利 李雅静 陶金山 张建强 翁雅娟 武慧 王秀美 赵一萍 | 2022 | 畜牧与饲料科学2022，43，5： | 0 |
| 6 | 基于家系基因组测序对骡基因组结构多样性分析显示文摘为分析马(Equus caballus)和驴(Equus asinus)杂交后两套结构和功能完善的独立基因组在骡基因组中整合后的结构多样性,本研究以马属动物三成员家系的全基因组序列为研究对象,分别以纯血马基因组和驴基因组为参考,识别驴、马和骡的InDel、SNP和CNV;通过生物信息分析,分析骡的de novo SNP及其突变频率、识别骡特异性CNV,并进行功能分析。结果显示:1)驴、马和骡分别获得100.01、103.78和114.36 Gb的高质量Illumina基因组测序数据。2)以纯血马基因组为参考,识别的InDels、SNPs和CNVs分别为402533~2110786、5012403~23819055和2126~3761;以驴基因组为参考,识别的InDels、SNPs和CNVs分别为527351~2279875、3212499~23549224和3572~7812。3)骡de novo SNPs分别为555和419,其突变频率为1.72×10^(-7)~2.21×10^(-7)。4)获得骡特异性CNVs分别为396和859,总长度分别为2.15和3.77 Mb。5)变异相关基因主要和机体的免疫及癌症过程相关。综上,骡基因组发生了高频率的de novo SNPs和特异性CNVs,这些结构变异可能对马和驴异种杂交不相容以及骡的遗传适应性具有重要意义,为进一步开展马和驴异种杂交的遗传基础及其分子机制的研究提供候选遗传位点。 | 任秀娟 苏少锋 李雅静 蔺雅楠 贾紫洁 丁文淇 白东义 李蓓 杜明 芒来 赵一萍 | 2023 | 中国农业大学学报2023，28，11： | 0 |
| 7 | 玉米ZmCCT10耐低氮功能研究显示文摘【目的】土壤氮素缺乏影响玉米的产量和品质,是中国玉米生产面临的重大问题。ZmCCT10编码转录因子,具有一因多效性,ZmCCT10是调控玉米生长发育和响应非生物胁迫重要的调节因子。解析玉米耐低氮的分子机制、聚合抗性基因,为培育耐低氮和氮高效玉米品种奠定基础。【方法】通过比较ZmCCT10近等基因系在低氮胁迫和完全营养水培条件下与耐低氮胁迫相关的性状,分析低氮胁迫后ZmCCT10的表达模式,选择ZmCCT10在近等基因系表达量差异最大的部位与时间点,进行转录组测序。发掘玉米ZmCCT10响应耐低氮反应的特征,探究其参与耐低氮反应的分子机制。【结果】在低氮胁迫条件下,ZmCCT10近等基因系Y331-ΔTE和Y331的根长性状、生物量、氮素生理指标显著差异。其中,ZmCCT10不带有转座子插入的单倍型Y331-ΔTE的总根长、主胚根长、侧根长均显著长于Y331;根干重、地上部干重、氮积累量、硝酸还原酶活性也显著高于Y331。在低氮胁迫后,ZmCCT10在根部和叶片的表达量均显著高于对照处理,且近等基因系间的表达量也具有显著差异,根部和叶片的表达模式也不同。胁迫处理3 h后,ZmCCT10在根部的表达量达到峰值,而在叶片的表达量随胁迫处理时间的增加而持续升高,在胁迫处理后6 h达到峰值。选取0.04 mmol·L^(-1)低氮胁迫处理3 h的根部样品进行转录组测序,生物学重复间的相关系数达0.9以上。GO富集分析表明,低氮胁迫后,参与胺化物合成过程和细胞氮化物代谢过程的基因在近等基因系间的表达量差异显著。结合差异基因的表达量和表达模式,筛选ZmCCT10调控参与玉米耐低氮反应的候选基因。经qRT-PCR验证,转录组测序获得的与耐低氮相关的ZmMPK5、ZmNS2等基因在近等基因系胁迫前后的表达量差异显著。【结论】ZmCCT10是一个以转录调控的方式参与玉米耐低氮反应的候选基因。 | 李懿璞 童丽秀 蔺雅楠 苏治军 包海柱 王富贵 刘剑 屈佳伟 胡树平 孙继颖 王志刚 于晓芳 徐明良 高聚林 | 2023 | 中国农业科学2023，56，6： | 0 |
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