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| 1 | 浅谈《蛋白质工程》教学体会显示文摘作为一门新兴的学科,蛋白质工程在带动生物学的进一步发展并推动与生产、生活关系密切相关学科的发展方面具有广阔的应用前景。为了培养从事蛋白质方面研究及生产的专业技术人才,我校为生物工程专业开设了《蛋白质工程》这门课程。本文通过对该课程教学的探索,从合理安排教学内容,合理使用多媒体,双语教学,实践教学等四个方面进行改进和尝试,以期对学生的理论学习效果和实践应用能力的提高有所帮助。 | 尤晓颜 韩静 | 2012 | 中国科教创新导刊2012，，32： | 4 |
| 2 | 油菜蜂花粉多酚超声波提取及抗氧化活性显示文摘使用超声波提取,Folin-Ciocalteu比色法测定总酚含量,以多酚提取率为考察指标,通过单因素和正交试验优化油菜蜂花粉多酚的最佳提取工艺;并通过清除羟自由基、亚硝酸根离子、DPPH和ABTS+·自由基能力测定,对油菜蜂花粉多酚的体外抗氧化活性进行评估。结果表明:油菜蜂花粉多酚的最佳提取工艺条件为60%乙醇作提取液、料液比1∶9(g/mL)、以固定功率(500 W)超声波提取3次、每次25 min,油菜蜂花粉多酚的得率为1.652%(即16.25 mg/g);在试验一定质量浓度范围内,油菜蜂花粉多酚对羟自由基、亚硝酸根离子、DPPH和ABTS+·自由基的最大清除率分别为90.34%、87.46%、67.45%和80.12%,具有较好的抗氧化作用。 | 龚明贵 张巧明 尤晓颜 | 2013 | 食品研究与开发2013，34，19： | 8 |
| 3 | 细胞工程实验教学改革与探索显示文摘实验教学是细胞工程的一个重要的组成部分,对细胞工程课程授课效果具有至关重要的作用。通过在构建合理的实验教学评价体系、强化学生能力和素质、进行开放式教学、加强科研促进教学等方面进行实验教学改革,从而提高了实验教学水平和质量,调动了学生的主动性和创造性,提高了学生学习兴趣。 | 赵君峰 尤晓颜 侯玉泽 | 2013 | 安徽农学通报2013，19，5： | 5 |
| 4 | 喜温嗜酸硫杆菌SM-1重金属抗性分子机制研究显示文摘目的:从基因组水平揭示冶金微生物喜温嗜酸硫杆菌SM-1的重金属抗性分子机制。方法:采用454 GSFLX测序平台对SM-1进行基因组测序,利用NCBI非冗余蛋白数据库、Uniport蛋白数据库以及基因组百科全书数据库(KEGG)对全基因组序列进行功能注释,通过比较基因组分析参与重金属抗性的基因及可能的分子机制。结果:基因组中34个基因编码重金属抗性相关蛋白,其中29个基因参与砷酸盐、汞、镉、锌、钴等重金属抗性机制;38个基因参与维持细胞内适宜的蛋白质折叠环境,这将有助于SM-1适应高浓度重金属离子的生物冶金环境。结论:基因组学手段为全面揭示喜温嗜酸硫杆菌的重金属抗性分子机制提供了帮助,也为进一步通过遗传改造提升其重金属抗性、进而提高冶金效率提供理论指导。 | 尤晓颜 马丽苹 姜成英 | 2013 | 生物技术2013，23，6： | 3 |
| 5 | 超声波辅助提取荷花粉黄酮显示文摘使用超声波提取,以黄酮提取率为考察指标,通过单因素和正交试验优化荷花粉黄酮的最佳提取工艺,并对荷花粉黄酮体外抗氧化活性进行评估。结果表明,荷花粉黄酮最佳提取工艺条件:乙醇体积分数70%,料液比1∶12(g/mL),提取次数3次,提取时间20 min,在此条件下荷花粉提取率为0.913%(9.13 mg/g)。 | 龚明贵 张巧明 尤晓颜 | 2013 | 农业工程2013，3，6： | 2 |
| 6 | 系列硫氧化还原酶(SOR)的同源建模显示文摘硫氧化还原酶(Sulfur oxygenase/reductase,SOR)在嗜热酸古菌硫氧化代谢中具有关键性作用,其催化机理和分子工程等都得到广泛关注.对SOR所涉及的亚基进行分子同源建模研究,并评估其可用性,通过1)序列相似性搜索,2)序列和结构比对,3)初始建模,4)分析和评估,5)精修和优化获得未知三维结构SOR的三维模型.同时讨论了此类蛋白质结构建模、评估策略、特征数据提取等. | 孟珍 尤晓颜 姜成英 马俊才 | 2010 | 应用与环境生物学报2010，16，3： | 1 |
| 7 | 体外人源三维肠道器官模型在微生物通讯中的研究进展显示文摘The human gut is inhabited by numerous and diverse microbial communities,forming a complex and dynamic ecosystem that regulates digestion,absorption,metabolism,and immunization.However,host-microbe interactions are complex and not well understood due to the difficulty of accessing some sections of the intestinal tract in vivo.The divergence in interspecies and intestinal microbial composition between animal models and humans as well as the difficulty in inferring causation from metagenomic sequencing have promoted the development of the human-relevant in vitro ecosystem of the gut-microbiota communication. | 王慧 尤晓颜 赵国屏 | 2023 | Science Bulletin2023，68，13： | 0 |
| 8 | 硕士研究生“高级食品生物技术”课程教学改革初探显示文摘高级食品生物技术是一门旨在提高研究生独立科研能力及开阔视野的课程,其教学方法直接影响着教学效果。文章对课程授课过程中存在的几个关键问题进行了阐述,并针对存在的问题进行系列教学改革探讨,以提高本课程的教学效果。 | 纠敏 尤晓颜 汪伦记 | 2021 | 科教导刊2021，，14： | 0 |
| 9 | 红曲米中桔霉素的高效液相色谱法检测显示文摘利用高效液相色谱法检测红曲米中的桔霉素,研究了红曲米萃取剂,烘干温度,红曲发酵时间对测出的桔霉素含量的影响,结果表明:在五种萃取剂里,甲酸的萃取效果最好.红曲米中测出的桔霉素的含量随烘干温度的增加而减少,在设定的烘干温度中,50℃时测出的桔霉素含量最高.随着固态发酵时间的延长,桔霉素生成量增加,至发酵后期生成量出现最大值,随后生成量开始减少. | 靳赛 尤晓颜 王玉芬 吴坤 | 2005 | 河南科学2005，23，2： | 10 |
| 10 | 嗜冷普鲁兰酶制备玉米抗性淀粉工艺优化及其表征显示文摘以玉米淀粉为原料,采用嗜冷普鲁兰酶脱支处理和压热处理相结合的方式制备玉米抗性淀粉,考察了玉米淀粉乳质量分数、耐高温α-淀粉酶添加量、嗜冷普鲁兰酶添加量、嗜冷普鲁兰酶作用时间对抗性淀粉得率的影响,采用正交试验对压热-酶解法制备玉米抗性淀粉的工艺参数进行了优化。采用扫描电子显微镜、X-射线衍射和差示扫描量热仪对玉米抗性淀粉形貌、晶体结构、热特性进行了观察与分析。结果表明,制备玉米抗性淀粉的最佳工艺条件为:玉米淀粉乳质量分数18%、耐高温α-淀粉酶添加量7 U/g、嗜冷普鲁兰酶添加量10 U/g、嗜冷普鲁兰酶作用时间9 h。在最佳条件下,玉米抗性淀粉得率为16.84%。玉米淀粉经复合酶法处理后,抗性淀粉形成了致密的层状晶体结构,表面形态结构呈现出不同于玉米原淀粉A型晶体结构的V型晶体结构;玉米抗性淀粉的起始温度、峰值温度、终止温度和相变焓值分别为117.07、140.69、153.03℃和1 858.12 J/g,均高于玉米原淀粉。 | 康怀彬 尤晓颜 肖天天 张晓宇 刘朝建 | 2016 | 食品科学2016，37，16： | 7 |
| 11 | 嗜冷普鲁兰酶产生菌NX-1的筛选及产酶条件优化显示文摘从南极海泥样品中分离得到一株产嗜冷普鲁兰酶的假交替单胞菌菌株(Pseudoalteromonas sp.)NX-1。以菌株NX-1为研究对象,对菌株NX-1产嗜冷普鲁兰酶的酶学性质进行了初步研究,并通过单因素试验和正交试验对其产嗜冷普鲁兰酶的最佳培养条件进行研究。结果显示,菌株NX-1所产嗜冷普鲁兰酶的最适作用温度为20℃,最适作用p H值为7.0,在最适条件下,酶的半衰期约为120 min;菌株NX-1的最适产酶条件为:培养温度20℃、接种量1%、培养基各组分含量分别为蔗糖15 g/L、蛋白胨15 g/L、Ca Cl2 0.5 g/L、Na2HPO4 6 g/L。优化后菌株产酶可达25.172 U/m L,相比优化前提高25.1%。 | 康怀彬 肖天天 李净净 杨桥 杨华田 尤晓颜 | 2015 | 食品科学2015，36，1： | 5 |
| 12 | 银条α-低聚半乳糖的免疫调节作用研究显示文摘以银条为原料,通过乙醇浸提与D101大孔吸附树脂初步纯化,制备得α-低聚半乳糖(α-GOS),并采用免疫抑制小鼠模型评价其免疫调节活性。结果表明:银条α-GOS含量为76.39%,主要由蔗糖、棉籽糖和水苏糖组成,其中水苏糖约占总α-GOS的86.03%。银条α-GOS能显著地提高环磷酰胺诱导的免疫功能低下小鼠脾脏指数、迟发型超敏反应的耳肿胀度和血清中溶菌酶的活性,且这种变化与银条α-GOS呈现剂量依赖关系。因此,银条α-GOS具有良好的免疫调节活性。 | 马丽苹 秦翠丽 邱智军 尤晓颜 曾晓雄 | 2013 | 食品工业科技2013，34，9： | 4 |
| 13 | 微生物完整基因组测定中的Gap closure策略显示文摘微生物基因组空缺区域(Gap)中可能存在重要的生物学信息,如果无法补齐所有Gap,不仅不能获得完整的基因组图谱,还会给后续的基因组信息解读造成很大困难。而基因组空缺区域填充(Gap closure)是获得微生物基因组完成图的关键,本文结合作者以及借鉴上海人类基因组研究中心在微生物基因组Gap closure中的经验,针对微生物基因组Gap closure常用的6种策略:参考序列比对、多引物PCR、基因组步移、基因组文库克隆末端测序、末端配对(Paired-End)以及基因组光学图谱技术进行综述。 | 尤晓颜 张彬 郑华军 姜成英 | 2014 | 微生物学通报2014，41，5： | 3 |
| 14 | 喜温嗜酸硫杆菌SM-1的ROS防护机制显示文摘【目的】从基因组水平探讨生物冶金微生物——喜温嗜酸硫杆菌(Acidithiobacillus caldus)的活性氧类物质(Reactive oxygen species,ROS)防护机制。【方法】采用罗氏454 GS FLX测序平台对喜温嗜酸硫杆菌SM-1进行全基因组测序,利用NCBI非冗余蛋白数据库、Uniport蛋白数据库对全基因组序列进行功能注释,并采用基因组百科全书数据库(KEGG)进行基因组代谢途径重构,通过比较基因组学方法分析SM-1基因组中参与ROS防护相关的基因及可能的分子机制。【结果】SM-1细胞内的酶促抗氧化系统可用于清除细胞内产生的ROS物质,而非酶促抗氧化系统可用于维持细胞内的还原性内环境;细胞内的DNA损伤修复系统可用于修复DNA的氧化损伤从而保持个体遗传物质的稳定性。此外,SM-1基因组中大量的转座元件可能会增加基因组的可塑性以适应极端冶金环境。【结论】SM-1基因组序列的获得为从整体水平揭示喜温嗜酸硫杆菌适应生物冶金环境ROS氧化损伤的防护机制提供了帮助,对于SM-1的ROS防护机制的认知也为进一步通过遗传改造、提升其在高浓度重金属离子冶金环境中的抗性、提高冶金效率提供了理论指导。 | 尤晓颜 李兆周 郑华军 姜成英 | 2014 | 微生物学通报2014，41，2： | 2 |
| 15 | 菊芋提取液的皮状丝孢酵母发酵产油脂试验研究显示文摘以皮状丝孢酵母为产油脂菌种,研究其发酵菊糖提取液产油脂情况。首先研究了从菊芋中提取菊糖的条件,获得最适提取条件为:温度85℃,时间80 min,菊芋粉质量浓度70 g/L,在此最优提取条件下,菊糖提取率达95%;然后考察了pH值、接种量、培养温度和氮源对皮状丝孢酵母发酵菊糖提取液产油脂的影响,获得最优条件为:初始pH值5.5、培养温度30℃、接种量10%。在此优化条件下,5 L发酵罐分批扩大培养,其生物量、出油率和油脂得率分别达到13.93 g/L、34.73%和4.89 g/L。补充添加氮源对生物量、出油率和油脂得率的提高不显著。气相色谱法测定脂肪酸成分主要是C16和C18系列,其中80.2%以上是C16:0、C18:1和C18:2,尤其是C18:1(43%),其油酸、棕榈酸和亚油酸占总脂肪酸的比例和植物油脂非常接近。 | 汪伦记 纠敏 吉艳青 尤晓颜 | 2014 | 中国粮油学报2014，29，9： | 2 |
| 16 | 好客嗜酸两面菌W1寡营养酸性热泉环境的适应机制显示文摘【目的】从基因组水平揭示好客嗜酸两面菌(Acidianus hospitalis)W1对寡营养酸性热泉环境的适应机制。【方法】使用NCBI非冗余蛋白数据库、Uniport蛋白数据库以及Sulfolobus数据库对好客嗜酸两面菌W1基因组序列进行功能注释,使用KEGG数据库对基因组进行In slico代谢途径重构,在此基础之上,采用比较基因组学方法对代谢途径进行鉴定和完善。【结果】好客嗜酸两面菌W1具备多样化的代谢方式以适应寡营养酸性热泉环境。W1菌株通过3-羟基丙酸/4-羟基丁酸和乙二酸-4-羟基丁酸循环进行CO2固定、通过氧化还原型无机硫化物(Reduced inorganic sulfur compounds,RISCs)获取能量营自养型生长。但W1菌株与模式菌株Acidianus ambivalens的硫代谢方式不同,W1基因组中缺少编码亚硫酸-受体氧化还原酶(SAOR)、腺苷硫酸(APS)还原酶、硫酸腺苷酰转移酶(SAT)和腺苷硫酸:磷酸腺苷转移酶(APAT)的基因。此外,W1菌株可以通过非磷酸化的分支的ED途径和TCA循环进行葡萄糖代谢,糖类和氨基酸转运蛋白以及相应水解酶的存在表明W1能够利用部分有机物营兼性自养型生长。与A.ambivalens不同,W1菌株不能利用H2作为电子供体。【结论】多样化的代谢方式为好客嗜酸两面菌W1更好地适应寡营养酸性热泉环境提供了重要保障,对于W1菌株特有代谢方式的揭示也丰富了对于嗜酸两面菌(Acidianus)属物种代谢多样性的认知。 | 尤晓颜 张巧明 郑华军 姜成英 | 2014 | 微生物学报2014，54，10： | 1 |
| 17 | 微生物学课程“神经元”式多维立体智慧教学资源构建探索 | 秦翠丽 侯颖 尤晓颜 宫强 孙晓菲 | 2023 | 中文科技期刊数据库(全文版)教育科学2023，，9： | 0 |
| 18 | 大肠杆菌必需基因的CRISPR-Cas9敲除策略及高效质粒置换方法显示文摘由于必需基因的功能必须性使其难以从基因组上被删除,而此前报道的方法存在效率低、非无痕敲除等缺点。基于此,该文建立了一种基于CRISPR/Cas9的基因组必需基因高效无痕敲除方法。以大肠杆菌metK基因(编码S-腺苷甲硫氨酸合酶)为例,首先将metK基因克隆至质粒pTarget-metK,并采用定点突变方式将metK基因进行同义突变移除对应的PAM序列,构建获得质粒pHL3。进一步构建含有与pHL3相同metK的回补质粒,pCas、pHL3及回补质粒依次转化即可完成基因组必需基因的高效无痕敲除。该方法对必需基因metK编辑时编辑效率可达100%。为了研究必需基因的酶学性质改变对宿主代谢的影响,探索了基于质粒不相容及Flp/FRT系统对回补质粒的置换效率,发现基于Flp/FRT系统可实现回补质粒高效置换。生长测试表明携带metK野生型或是PAM位点突变的metK编辑菌株与野生型菌株在LB培养基和M9培养基中生长无明显差异,而对L-甲硫氨酸亲和力下降MetK突变体则表现明显的生长延滞。 | 刘锦辉 黄建峰 尤晓颜 张燕飞 | 2023 | 食品与发酵工业2023，49，18： | 0 |
| 19 | 一株铅黄肠球菌噬菌体的生物学特性和全基因组分析显示文摘【目的】铅黄肠球菌是医源感染的机会致病菌,可引起危及生命的败血症、脑膜炎等,但针对其噬菌体的研究尚属空白。噬菌体作为细菌病毒,具有宿主特异性。本研究首次分离到可培养的铅黄肠球菌烈性噬菌体,对其基因组序列的分析和其他特征研究为进一步探讨噬菌体与宿主的作用机制及治疗应用提供参考。【方法】噬菌体Ecf_virus_SZ01以健康人粪便中分离的铅黄肠球菌(DO55)作为宿主菌,分离自深圳市南山区未经处理的生活污水样本,利用透射电镜观察噬菌体形态并对其生物学特征和基因组特点进行研究。【结果】透射电镜显示,噬菌体Ecf_virus_SZ01头部直径约为106 nm,尾部直径约为150 nm,尾长且无伸缩性尾鞘,属长尾噬菌体科;该噬菌体的最佳感染复数为0.01;一步生长曲线显示,潜伏期约为30 min,每个受感染细胞产生子代的平均数量为50 PFU/cell;抑菌曲线显示MOI=0.01时对宿主菌具有很好的抑制效果;宿主特异性强,不能实现跨属侵染;测序结果显示其基因组为dsDNA,长度为59409 bp,GC含量为43.2%;该噬菌体共有102个开放阅读框,BLASTn比对显示该噬菌体与NCBI数据库中其他噬菌体相似性极低。【结论】首次分离到宿主为铅黄肠球菌的噬菌体,具有潜伏期短、裂解能力强、宿主专一的特征,基因组与数据库中现有噬菌体相比十分新颖,并对其生物学特性和基因组进行了分析。 | 张洁琼 沈俊涛 莫洛菲 马迎飞 尤晓颜 | 2022 | 微生物学报2022，62，10： | 0 |
| 20 | 微生物学课程思政“点-线-面-体”教学改革探索 | 秦翠丽 侯颖 宫强 尤晓颜 张勇法 | 2023 | 中文科技期刊数据库(全文版)教育科学2023，，8： | 0 |
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